不同营养方式真菌中分泌蛋白数量及其功能对比研究

摘要

[目的]分泌蛋白在植物病原真菌致病过程中发挥着重要的作用,前人多以单种菌株分泌蛋白预测分析,尚未见多种类型真菌中分泌蛋白的预测及对比研究报道.[方法]本研究基于多种不同营养方式真菌的全基因组序列,根据分泌蛋白所具有的基本特征,采用在线分析程序(主要包括SignalP v5.0、ProtComp v9.0等)对模式生物、死体营养型真菌、半活体营养型真菌及活体营养型真菌共19种菌株的分泌蛋白开展预测及功能分析.[结果]在上述真菌约13万条蛋白序列中,分泌蛋白所占比例为0.74％-4.83％,其中,活体营养型真菌所具有的分泌蛋白数量占比最高,平均为3.51％,而死体营养型真菌和模式生物平均比例最低,平均为1.36％.同时,活体营养型真菌具有的功能种类最多,为433种,其次为半活体营养型真菌,为266种,而模式生物具有的功能种类最少,为100种,其中,功能为假设蛋白和非特征蛋白的蛋白数量最多.[结论]该研究为深入解析分泌蛋白在实现不同营养方式真菌的致病机制方面提供理论依据.