环境空气暴露对猪粪悬液中菌群及代谢物的影响

摘要

目的 研究环境空气暴露对制备的粪悬液中微生物及代谢物的影响.方法 收集无特定病原体级巴马小型猪粪便:(1)未处理组(C组);(2)有氧暴露处理组(T1组);(3)厌氧暴露处理组(T2组).利用扩增子测序技术和非靶向代谢组比较各组粪样的微生物群落组成及代谢产物.结果 (1)T1和T2组粪悬液制备操作均保存了新鲜粪便中(C组)的全部细菌门,仍以厚壁菌门和拟杆菌门细菌为主,但显著降低了密螺旋体属细菌的丰度;(2)猪粪便中以子囊菌门、担子菌门真菌为主,粪悬液制备显著提高了猪粪便中子囊菌门真菌的丰度;有氧暴露处理去除了猪粪便中节单菌属真菌.(3)LC-MS结果显示:正负离子模式下各识别出402、195种代谢物,其中T1:C代谢集、T2:C代谢集的差异代谢物分别为155和201个.结论 猪粪悬液制备时间虽然不长,但有氧暴露对样本中真菌群落丰度的影响高于厌氧暴露,都显著地降低Treponema和Spirochaetes等有害菌群和相关代谢产物的丰度,提高了FMT的安全性.