地黄RgPR1基因的克隆、生物信息学及表达分析

摘要

基于实验室前期获取的地黄转录组数据,设计了特异性引物,克隆了完整的RgPR1基因序列,通过生物信息学等方法对编码蛋白质进行了分析;利用荧光定量PCR方法分析了植物激素水杨酸和茉莉酸诱导下的RgPR1基因组织差异性表达。结果显示,RgPR1基因全长668 bp,共编码163个氨基酸,其编码的蛋白可能定位于细胞外,为不稳定的分泌蛋白。RgPR1蛋白与一串红的PR1蛋白的同源性最高;经水杨酸和茉莉酸处理后,PR1基因在地黄根、茎、叶中均显著提高,其中在叶中的表达量最高,根中次之,茎中的表达量最低。本研究成功克隆出RgPR1基因,发现其在不同组织中的表达具有一定的差异性,且外源水杨酸和茉莉酸对其表达具有调节作用,为进一步研究PR1基因在地黄抗病中的作用奠定了基础。