钠升电喷雾串联质谱技术鉴定两种髓系白血病细胞分化相关蛋白质

摘要

目的鉴定IL-6诱导小鼠髓系白血病M1细胞分化过程中出现的两种上调表达的相关蛋白质.方法 将待鉴定的蛋白质斑点从双向电泳凝胶上切下,经胶内胰蛋白酶酶切后,先进行基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)肽质量指纹谱分析,再通过钠升电喷雾串联质谱(nano-ESI-MS/MS)技术获得其胰蛋白酶水解肽段的串联质谱图和肽段的全长序列,串联质谱图经Micromass专用软件MaxEnt3处理后,通过Mascot查询NCBI、SWISSPROT等数据库.结果两种未能通过肽质量指纹谱鉴定的蛋白质经Nano-ESI-MS/MS技术获得了明确鉴定,分别为蛋白质Destrin和Putative.结论 Nano-ESI-MS/MS通过获得多肽序列信息在鉴定蛋白质方面具有独特的优势.