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第一章 绪论
1.1研究背景
1.2 GPCRs概述
1.2.1 GPCRs的结构
1.2.2 GPCR超家族的分类和GPCR数据库
1.2.3 GPCRs配基结合域
1.2.4 GPCRs活化的分子机制和模式
1.2.5 GPCRs的二聚化
1.2.6 GPCRs失敏和内吞
1.2.7 GPCRs的信号传导机制
1.3研究内容和目的
1.3.1研究内容
1.3.2研究目的
1.4论文的组织结构
第二章 G蛋白偶联受体功能位点的预测
2.1前言
2.1材料和方法
2.1.1材料
2.1.2方法
2.2结果
2.2.1一致序列的跨膜区
2.2.2生物胺受体各家族的保守性
2.2.3特异性阈值和序列数目之间的关系
2.2.4全局功能位点
2.2.5子家族特有的功能位点
2.3讨论
2.3.1全局功能位点分析
2.3.2亚家族特有功能位点分析
2.3.3预测方法和性能分析
2.3.4 GPCRs其它家族功能位点
2.4本章总结
第三章 G蛋白偶联受体功能性SNPs的预测
3.1前言
3.1.材料和方法
3.1.1数据集
3.1.2预测属性
3.1.3预测方法
3.1.4单个属性预测能力
3.1.5最优属性子集的选择
3.1.6搜索策略
3.1.7算法性能评价
3.2结果
3.2.1功能性突变和非功能性突变在属性上的分布
3.2.2单个属性的预测能力分析
3.2.3最优属性子集
3.2.4最优属性子集的验证
3.2.5决策树算法与wrapper属性子集的泛化性能
3.2.6功能性SNPs的规则库
3.2.7 GPCRs中的功能性SNPs
3.2.8不同家族功能性SNPs的分布
3.3讨论
3.4本章总结
第四章 结论与展望
4.1结论
4.2展望
参考文献
附录:GPCRs其它家族的功能位点
攻读博士学位期间发表的论文
致谢
上海大学;