调控蛋白质相分离的关键氨基酸序列预测

目录

声明

摘要

1 概述

1．1蛋白质相分离研究背景

1．2国内外研究进展

1．2．1传统实验方法及数据库

1．2．2相分离传统预测工具

1．2．3机器学习算法的应用

1．3研究目的及意义

1．4研究内容

2数据收集以及特征描述

2．1引言

2．2材料与方法

2．2．1数据收集与预处理

2．2．2数据特征分析

2．3结果与讨论

2．3．1基准数据集的确定

2．3．2调控相分离区域特征

2．4本章小结

3预测模型的构建和评估

3．1引言

3．2材料与方法

3．2．1特征提取

3．2．2机器学习算法

3．2．3超参数优化

3．2．4肽段长度选择

3．2．5模型评估

3．3结果与讨论

3．3．1模型构建

3．3．2模型评估

3．4本章小结

4 dSCOPE在线工具的开发

4．1引言

4．2材料与方法

4．2．1数据集准备

4．2．2dSCOPE网站搭建

4．2．3分子凝聚物富集分析

4．3结果与讨论

4．3．1dSCOPE用法说明

4．3．2dSCOPE应用

4．4本章小结

5蛋白质组水平的预测和分析

5．1引言

5．2材料与方法

5．2．1翻译后修饰分析

5．2．2功能注释和通路富集分析

5．2．3激酶与上游转录因子富集分析

5．2．4泛癌症突变分析

5．3结果与讨论

5．3．1相分离蛋白翻译后修饰分析

5．3．2相分离蛋白功能注释和通路富集分析

5．3．3相分离蛋白上游激酶与转录因子富集分析

5．3．4相分离相关突变分析

5．4本章小结

6总结与展望

6．1全文总结

6．2研究展望

文献综述

参考文献

个人简历、在校期间发表的学术论文和研究结果

致谢