南极长城湾海洋沉积物及潮间带微生物的群落结构及宏基因组学研究

目录

1 绪论

1.1 南极地区微生物的研究进展

1.1.1 南极微生物概况

1.1.2 海洋沉积物及潮间带微生物的研究概况

1.2 微生物的研究方法

1.3 研究意义和研究内容

1.3.1 研究意义

1.3.2 研究内容

1.3.3 技术路线

2 海洋沉积物和潮间带的微生物多样性硏究

2.1 实验材料与设备

2.1.1 样品来源

2.1.2 实验试剂和仪器

2.2 分析方法及数据库

2.3 研究方法

2.3.1 高通量测序

2.4 海洋沉积物和潮间带样品中的细菌和古菌

2.4.1 物种丰度

2.4.2 基于门水平多样性分析

2.4.3 基于纲水平多样性分析

2.4.4 基于属水平多样性分析

2.4.5 基于属水平的P C oA分析

2.4.6 基于O T U水平的Veen图分析

2.4.7 C C A分析

2.5 海洋沉积物和潮间带样品中的微型真核生物

2.5.1物种丰度和多样性

2.5.2基于门和纲水平的柱状图分析

2.5.3基于属水平的P C oA分析

2.5.4基于属水平的 H ea t m a p图分析

2.5.5 基于O T U水平的Veen图分析

2.5.6 C C A分析

2.6 理化性质

2.7本章小结

3宏基因组学研究

3.1 物种与功能组成分析

3.2 第二、三级功能基因分析

3.3 P C A分析

3.4 C C A分析

3.5 物种与功能贡献度分析

3.6 本章小结

4 可培养微生物多样性研究

4.1 材料和方法

4.1.1 样品采集

4.1.2 样品分离培养方法

4.1.3 预实验、菌株保藏、细菌 16S r R NA 基因测序及其分析

4.2 结果和分析

4.2.1 预实验结果

4.2.2 可培养细菌的多样性分析

4.2.3 不同平板可培养细菌的多样性

4.3 本章小结

5 总结与展望

5.1 总结

5.2研究展望

参考文献

致谢

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