高风险源抗性基因污染特征及紫外/氯削减抗性基因机制研究

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致谢

1 引言

1.2高风险抗性污染源分布特征

1.3微生物耐药和抗性传播机制

1.3.2抗性基因分类

1.3.3抗性基因水平转移机制

1.4抗性基因的消毒削减技术

1.4.2氯消毒的应用

1.5研究意义、研究内容和技术路线

1.5.2研究内容

1.5.3技术路线

2 材料和方法

2.1 材料

2.1.2实验试剂

2.1.3实验耗材

2.1.5引物序列

2.2实验方法

2.2.2细菌分离和鉴定

2.2.3细菌培养

2.2.5 RNA提取

2.2.6 DNA提取

2.2.8绝对定量PCR

2.2.9高通量测序和微生物群落多样性分析

2.2.12消毒实验

2.2.13细菌光活化实验

2.2.15统计学检验

3细胞培养废液微生物群落结构及抗性基因关联分析

3.1.1群落组成结构分析

3.1.2群落组成热图分析

3.1.3物种Venn图分析

3.1.4物种组间差异分析

3.2细胞培养废液中ARGs和MGEs分布特征

3.3细胞培养废液中ARGs与MGEs之间的共现模式分析

3.4细胞培养废液中ARGs和MGEs的宿主分析

3.5细胞培养废液样本、ARGs种类和细菌群落之间的关联分析

3.6本章小结

4畜禽养殖污水微生物群落结构及抗性基因关联分析

4.1.1群落组成结构分析

4.1.2群落组成热图分析

4.1.3物种Venn图分析

4.1.4物种组间差异分析

4.2畜禽养殖场污水中ARGs和MGEs分布特征

4.3畜禽养殖场污水中ARGs与MGEs之间的共现模式分析

4.4畜禽养殖场污水中ARGs和MGEs的宿主分析

4.5畜禽养殖场污水ARGs种类和细菌群落之间的关联分析

4.6本章小结

5污水处理系统微生物群落演替及抗性基因关联分析

5.1.1群落组成结构分析

5.1.2群落组成热图分析

5.1.3物种Venn图分析

5.1.4物种组间差异分析

5.2污水处理系统中ARGs和MGEs分布特征

5.3污水处理系统中ARGs与MGEs之间的共现模式分析

5.4污水处理系统中ARGs和MGEs的宿主分析

5.5污水处理系统中ARGs种类和细菌群落之间的关联分析

5.6本章小结

6紫外／氯协同削减ARB和ARGS及阻遏基因水平转移机制

6.1.2菌株基因组扫描分析

6.2不同剂量下紫外／氯消毒灭活与光复活实验

6.2.1紫外／氯消毒实验

6.2.2光复活实验

6.3不同剂量下紫外／氯消毒的ARG削减分析

6.3.2紫外／氯消毒ARG削减实验

6.4不同剂量下紫外／氯消毒的阻遏基因水平转移分析

6.4.2紫外／氯消毒的控制基因水平转移的机制分析

6.5本章小结

7结论与展望

7.2创新点

7.3 展望

参考文献

作者简历及攻读博士学位期间取得的研究成果

独创性声明

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