基于线粒体基因组的稻蝗属广布物种系统发育研究

目录

第一章 文献综述

1.1斑腿蝗科稻蝗属的分类学研究

1.1.1斑腿蝗科

1.1.2 稻蝗属系统发育研究进展

1.2线粒体基因组介绍

1.2.1动物线粒体DNA

1.2.2 线粒体RNA二级结构变化

1.3线粒体基因组学研究意义

1.3.1线粒体基因组在系统发育研究的应用

1.3.2 线粒体基因组应用于系统发育研究的优势

1.3.3利用全线粒体基因组联合数据进行昆虫系统发育分析

1.4研究选题的目的及意义

第二章 实验材料与方法

2.1 实验材料

2.1.1标本的采集、保存与鉴定

2.1.2实验仪器

2.1.3实验试剂

2.1.4生物信息学数据分析软件

2.2实验方法

2.2.1基因组DNA提取

2.2.2 线粒体基因组的RT-PCR扩增

2.3 PCR扩增产物的序列的组装与注释

2.3.1 测序数据处理和初步分析

2.3.2 线粒体基因组的基因定位及注释

2.3.3二级结构的预测

2.4线粒体基因组系统发育分析

第三章 结果分析和讨论

3.1 小稻蝗线粒体基因组分析

3.1.1基因组结构

3.1.2蛋白质编码基因和密码子使用频率

3.1.3 tRNA基因

3.1.4 rRNA基因

3.2中华稻蝗线粒体基因组分析

3.2.1基因组结构

3.2.2蛋白质编码基因和密码子使用频率

3.2.3 tRNA基因

3.2.4 rRNA基因

3.3日本稻蝗

3.3.1 基因组结构

3.3.2 蛋白质编码基因和密码子使用频率

3.3.3 tRNA基因

3.3.4 rRNA基因

3.4 赤胫伪稻蝗

3.4.1基因组结构

3.4.2蛋白质编码基因和密码子使用频率

3.4.3 tRNA基因

3.4.4 rRNA基因

3.5系统发育分析

第四章 小 结

参考文献

致谢

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