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太湖水华蓝藻群落和胶鞘多糖代谢及其基因表达模式的研究

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摘要

缩略词对照表

绪论

第一章文献综述

1.1水体富营养化及蓝藻水华

1.1.1蓝藻水华的发生机理及影响因素

1.1.2蓝藻水华特点及胶鞘多糖的重要性

1.2蓝藻水华代表性湖泊太湖概况

1.3太湖蓝藻的主要组成种类

1.3.1微囊藻

1.3.2鱼腥藻

1.4本文蓝藻主要研究方法

第二章太湖水华蓝藻群落结构及其胶鞘多糖的变化

2.1材料与方法

2.1.1样品采集及处理

2.1.2环境因子测定

2.1.3 DNA提取及MiSeq高通量测序

2.1.4胶鞘多糖提取及相关分析

2.1.5数据处理

2.2结果与分析

2.2.1太湖梅梁湾水体温度及Chla的全年变化

2.2.2太湖梅粱湾蓝藻群落组成分析

2.2.3太湖梅梁湾环境理化因子与蓝藻群落组成关联分析

2.2.4蓝藻群体胶鞘多糖的含量及组成变化

2.2.5蓝藻群体胶鞘多糖的含量与蓝藻群落组成关联分析

2.3讨论

2.3.1蓝藻群落结构与环境理化因子间的关系

2.3.2蓝藻胶鞘多糖物质组成及与群落结构的关系

2.4小结

第三章蓝藻群体总RNA提取方法的比较研究

3.1.1实验材料

3.1.2实验方法

3.1.3数据处理

3.2结果与分析

3.2.2 RNA完整性检测

3.2.3 RNA的产量和纯度分析

3.2.4 qPCR检测基因组DNA污染

3.2.5反转录荧光定量PCR检测Rbcl基因的mRNA水平

3.3讨论

3.4小结

第四章太湖水华蓝藻群体及胶鞘多糖代谢相关基因表达模式分析

4.1材料与方法

4.1.1野外样品处理

4.1.2 RNA提取及宏转录组测序

4.1.3数据处理

4.2结果与分析

4.2.1蓝藻群体宏转录组分析的物种组成

4.2.2蓝藻群体在subsystem level1上基因表达分析

4.2.3梅梁湾环境理化因子与蓝藻群体基因表达的RDA分析

4.2.4蓝藻群体胶鞘多糖相关基因表达分析

4.2.5梅梁湾环境因子与胶鞘多糖相关基因表达的RDA分析

4.2.6多维尺度分析(MDS)法分析蓝藻基因表达

4.2.7基于edgeR两两对比分析不同水华期蓝藻相关基因的表达差异

4.3讨论

4.3.1宏转录组方法的应用

4.3.2蓝藻群体主要代谢基因分析

4.3.3蓝藻胶鞘多糖相关基因分析

4.3.4蓝藻水华不同时期及基因表达差异分析

4.4小结

第五章微囊藻和鱼腥藻应对温度波动下基因表达模式及胶鞘多糖相关基因的研究

5.1材料与方法

5.1.1藻种来源及培养

5.1.2实验方法

5.1.3 Chla浓度及光合活性测定

5.1.4胶鞘多糖提取及相关分析

5.1.5 RNA提取及宏转录组测序

5.1.6数据处理

5.2结果与分析

5.2.1温度变化对2种藻群体生长的影响

5.2.2温度变化对2种藻群体光合活性的影响

5.2.3温度变化对2种藻群体胶鞘多糖含量的影响

5.2.4宏转录组分析室内不同处理组2种藻群体基因表达

5.3讨论

5.3.1 2种藻群体随温度变化差异明显的基因研究

5.3.2室内与野外结果相结合分析

5.4小结

结论与展望

参考文献

致谢

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著录项

  • 作者

    高胜玲;

  • 作者单位

    南京农业大学;

  • 授予单位 南京农业大学;
  • 学科 生物学;生物化学与分子生物学
  • 授予学位 硕士
  • 导师姓名 卢亚萍;
  • 年度 2018
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 X52X17;
  • 关键词

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