MERS-CoV基因组流行病学及2019-nCoV的系统发育初步分析

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英文缩略词

1 前言

2 材料与方法

2.1 材料

2.1.1 MERS-CoV、2019-nCoV及SARS-CoV基因组来源

2.1.2 生物信息学在线服务器及软件

2.2 方法

2.2.1 MERS相关冠状病毒基因组的流行病学分析

2.2.2 序列比对及系统发育分析

2.2.3 氨基酸替换分析

2.2.4 S蛋白的结构预测

3 结果

3.1 MERS相关冠状病毒基因组的流行病学分析

3.1.1 MERS相关冠状病毒基因组来源宿主分布

3.1.2 MERS相关冠状病毒基因组来源国家分布

3.1.3 MERS相关冠状病毒基因组分离年份的数量变化

3.1.4 MERS相关冠状病毒基因组分离月份的数量变化

3.1.5 MERS相关冠状病毒基因组不同标本来源分布

3.2 序列比对及系统发育分析

3.2.1 MERS相关冠状病毒基因组的序列比对及系统发育分析

3.2.2 MERS-CoV与2019-nCoV的序列一致性分析

3.2.3 2019-nCoV的同源基因组

3.2.4 MERS-CoV、2019-nCoV及SARS-CoV基因组的系统发育分析

3.3 氨基酸替换分析

3.3.1 全球MERS-CoV S蛋白的氨基酸替换分析

3.3.2 MERS-CoV、2019-nCoV及SARS-CoVS蛋白氨基酸替换分析

3.4 S蛋白结构预测

3.4.1 不同分支MERS-CoV S蛋白的结构预测

3.4.2 2019-nCoV与SARS-CoV S蛋白的结构预测

4 讨论

4.1 MERS相关冠状病毒基因组流行病学分析

4.2 MERS冠状病毒基因组的系统发育分析及S蛋白分析

4.2.1 MERS相关冠状病毒基因组的系统发育分析

4.2.2 MERS冠状病毒的S蛋白分析

4.3 2019-nCoV的系统发育分析及S蛋白分析

5 创新性与局限性

6 结论

参考文献

综述:中东呼吸综合征（MERS）研究进展

个人简历

致谢