普通小麦淀粉相关品质性状的全基因组关联分析

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摘要

1文献综述

1．1淀粉的结构和功能

1．1．1淀粉的结构

1．1．2淀粉的生物合成

1．1．3小麦淀粉及其组分的影响因素

1．1．4小麦淀粉性状与品质的关系

1．1．5小麦淀粉品质性状的遗传研究

1．2分子标记技术发展

1．2．1 限制性片段长度多态性标记(Restriction Fragment Length Polymorphism，RFLP)

1．2．4单核苷酸多态性(single Nucleotide Polymorphism,SNP)

1．3关联分析及其应用

1．3．1关联分析的基础

1．3．2关联分析的应用

2．引言

3．材料与方法

3．1试验材料及田间种植

3．2小麦品质测定

3．2．3支链淀粉含量(Amylopectin content，Ac)测定

3．2．4籽粒硬度、蛋白质含量、湿面筋含量测定

3．3 DNA提取以及SNP分型

3．4群体结构与主成分分析

3．5数据统计与分析

3．5．1表型数据的统计分析

3．5．2 SNP标记的统计分析

3．5．3连锁不平衡分析

3．6关联分析与候选基因的筛选

4结果与分析

4．1群体结构与主成分分析

4．2 SNP标记分析

4．3连锁不平衡分析

4．4小麦品质性状的基本统计量

4．5小麦品质性状间的相关性

4．6小麦品质性状的关联分析

4．6．1小麦品质性状频率分布图

4．6．2小麦淀粉品质性状的关联位点

4．6．3小麦蛋白质含量、湿面筋含量和籽粒硬度的关联位点

4．6．4一因多效的SNP位点

4．6．5小麦淀粉品质性状的优势等位变异

4．6．6小麦蛋白质含量、湿面筋含量和籽粒硬度的优势等位变异

4．7候选基因功能分析

5结论与讨论

5．1小麦35K芯片数据分析

5．2小麦品质性状间的相关性

5．3小麦品质性状的关联分析

5．3．1小麦淀粉性状的关联分析

5．3．2小麦蛋白质含量、湿面筋含量和籽粒硬度的关联分析

5．4小麦品质性状的候选基因

参考文献

附录