CHUK基因与缺血性脑卒中及其中医证型遗传易感性的关联研究

摘要

目的：　　螺旋环螺旋结构域扩散激酶（conserved helix-loop-helix ubiquitous kinase，CHUK）基因编码的复合物IKKα是核因子NF-κB信号通路必要的调节器之一，而核因子NF-κB信号通路被发现是缺血性脑卒中发生过程中的一个重要的炎症介质，既往研究发现CHUK参与脂质代谢和舒张压调节。本研究旨在探讨CHUK基因rs3808916，rs2230804和rs3808917多态性与缺血性脑卒中（ischemic stroke,IS）及其中医证型、数量性状的相关性。　　方法：　　共纳入IS病例816例（男性465例，女性351例），和性别、年龄相匹配的对照816例（男性433名，女性383名）。采用北京天根科技有限公司（Tiangen Biotech， Beijing， China）的血液基因组DNA提取试剂盒提取DNA，运用Sequenom MassARRAY技术对CHUK基因的rs3808916，rs2230804和rs3808917进行基因分型检测。采用汞柱式血压计测量研究对象收缩压（systolic pressure，SBP）和舒张压（diastolic blood pressure，DBP）。采用HITACHI日立7600全自动生化分析仪检测IS患者总胆固醇（totalcholesterol，TC）、甘油三酯（triglyceride，TG）、高密度脂蛋白胆固醇（highdensity lipoprotein cholesterol，HDL-C）、低密度脂蛋白胆固醇（low densitylipoprotein cholesterin，LDL-C）。使用SPSS16.0 for windows软件，PLINK软件（http://pngu.mgh.harvard.edu/~purcell/plink/）进行相关统计分析。　　结果：　　1.哈温平衡（Hardy-Weinberg Equilibrium，HWE）检验：CHUK基因的rs3808916，rs2230804和rs3808917在对照组中的基因型分布均符合HWE平衡定律（均为P>0.050）。　　2. CHUK基因多态性与IS遗传易感性的关联分析：　　①分别在各个遗传模型中，CHUK基因的rs3808916，rs2230804和rs3808917多态性与IS遗传易感性的关联均无统计学意义（均为P>0.050）；　　②在性别分层分析中， CHUK基因的rs3808916，rs2230804和rs3808917多态性与IS遗传易感性的关联亦无统计学意义（均为P>0.050）　　3. CHUK基因多态性与IS相关中医证型的关联分析：　　①风痰瘀阻证：在各个遗传模型分析中，均未发现CHUK基因rs3808916，rs2230804和rs3808917多态性与IS遗传易感性的关联有统计学意义（均为P>0.050）；　　②气虚血瘀证: CHUK基因rs3808916，rs2230804和rs3808917多态性位点与IS遗传易感性的关联亦无统计学意义（均为P>0.050）。　　4. CHUK基因多态性与IS患者相关数量性状的关联分析：　　①CHUK基因rs2230804多态性与缺血性脑卒中患者DBP水平的关联有统计学意义（加性模型：β=1.52,95％CI=0.11 to2.93, P=0.035；隐性模型：β=2.62,95%CI=0.25 to5.00, P=0.031）；rs3808917多态性在隐性遗传模型中与缺血性脑卒中患者TG水平的关联有统计学意义（β=0.19,95%CI=0.00 to0.37, P=0.046）。而CHUK基因rs3808916多态性与缺血性脑卒中患者相关数量性状（TG、TC、HDL、SBP及DBP）均无统计学关联(均为P>0.050)。　　②在男性中，CHUK基因rs2230804多态性与IS患者血清HDL水平相关性有统计学差异（隐性模型:Padj=0.024）。CHUK基因rs3808917多态性与IS患者血清HDL水平相关性亦有统计学差异（加性模型: P=0.043， Padj=0.047）；CHUK基因rs3808916多态性与IS患者血清TC， TG， HDL， LDL水平及SBP，DBP水平相关性均无统计学差异(all P>0.050)　　③在女性中，CHUK基因rs3808916多态性与IS患者血清LDL水平相关性有统计学差异（隐性模型: Padj=0.043）；rs2230804多态性与IS患者血清TG水平相关性具有统计学差异（显性模型:Padj=0.030），其与IS患者血清LDL水平相关性亦具有统计学差异（加性模型: P=0.029，Padj=0.035）。另外，rs2230804多态性与IS患者DBP水平相关性有统计学差异（隐性模型:Padj=0.018）。CHUK基因 rs3808917多态性与IS患者血清TG水平相关性有统计学差异(P=0.011，Padj=0.015）。　　5. CHUK基因多态性与IS不同中医证候患者相关数量性状的关联分析　　①CHUK基因rs3808916多态性在隐性遗传模型中与缺血性脑卒中风痰瘀阻证患者LDL水平的关联有统计学意义（P=0.046）。　　②CHUK基因rs3808916多态性与缺血性脑卒中气虚血瘀证患者SBP水平的关联有统计学意义（加性模型：P=0.043；显性模型：P=0.033）。rs3808917多态性与缺血性脑卒中气虚血瘀证患者TG水平的关联有统计学意义（加性模型：P=0.035；隐性模型：P=0.025）。　　结论：　　CHUK基因的rs3808916，rs2230804和rs3808917多态性与缺血性脑卒中发病风险及其风痰瘀阻证及气虚血瘀证均无明确关联。但是，CHUK基因rs2230804位点与IS患者的舒张压（DBP）水平有关，rs3808916多态性可能与IS气虚血瘀证患者收缩压（SBP）水平相关。rs3808917可能与广西汉族IS患者甘油三脂（TG）水平相关，rs2230804可能与广西汉族女性IS患者甘油三脂（TG）水平相关，并且rs3808917多态性可能影响IS气虚血瘀证患者甘油三脂（TG）代谢。rs3808916和rs2230804可能与广西汉族女性IS患者低密度脂蛋白（LDL-C）水平相关，并且rs3808916可能影响IS风痰瘀阻证患者LDL代谢。rs2230804及rs3808917可能与男性IS患者高密度脂蛋白（HDL-C）水平相关。

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引言

1 研究对象与方法

1.1 研究对象

1.1.1病例分组

1.1.2诊断标准

1.1.3纳入标准

1.1.4排除标准

1.1.5中止及剔除标准

1.1.6研究对象信息数据收集

1.2研究样本DNA提取

1.2.1主要试剂及其耗材

1.2.2主要仪器设备

1. 3 实验方法

1. 3.1生化指标测定

1.3.2 DNA提取步骤和储存

1.3.3 DNA 纯度和浓度定量

1.3.4基因分型

1.4质量控制

1.5统计分析

2 结果

2.1病例组与对照组一般特征比较

2.2 Hardy-Weinberg Equilibrium (HWE) 检验

2.3 CHUK基因单位点关联分析

2.3.1 CHUK基因多态性与IS 遗传易感性的关联分析

2.3.2 CHUK 基因多态性位点rs3808916, rs2230804, rs3808917与IS中医证型的关联分析

2.4 缺血性脑卒中相关数量性状关联分析

2.4.1 CHUK 基因多态性rs3808916, rs2230804, rs3808917与IS 患者相关数量性状的关联分析

2.4.2 CHUK基因多态性rs3808916, rs2230804, rs3808917在中国汉族人IS不同中医证型人群与IS相关数量性状关联分析

3 讨论

3.1基因多态性与IS 相关数量性状关联分析

3.2CHUK基因SNPs与IS不同中医证型患者血脂水平的关联分析

3.3存在的问题和展望

结论

参考文献

附录

缩略词表

综述:CHUK 基因与缺血性脑卒中的研究概况

致谢

个人简历及攻读学位期间获得的科研成果