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清开灵有效组分治疗中风的网络药理学研究

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引言

正文

1资料与方法

1.1 黄芩苷、栀子苷、胆酸相关基因、蛋白质的获取

1.2 黄芩苷、栀子苷、胆酸相关基因—蛋白质协同作用网络的构建

1.3 黄芩苷、栀子苷、胆酸相关基因—蛋白质相互作用网络映射到中风相关基因—蛋白质相互作用网络

1.4 网络拓扑属性分析

1.5 划分功能模块

1.6 GO功能富集分析

2 结果

2.1 PubChem Compound中与黄芩苷、栀子苷、胆酸相关的基因

2.2基因/蛋白质相互作用网络

2.3 网络分析

2.4 GO功能富集分析

3 讨论

3.1 祖国医学对中风的认识

3.2 现代医学对中风的认识

3.3 清开灵方药的探讨

3.4 选择黄芩苷、栀子苷、胆酸的依据

3.5 黄芩苷、栀子苷、胆酸治疗中风的网络药理学分析

3.6 网络药理学在中医药研究中的应用

4 存在问题与展望

结论

参考文献

综述

致谢

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摘要

目的:通过比较黄芩苷、栀子苷、胆酸治疗中风的靶点网络的网络拓扑属性、模块性、GO富集结果,从网络药理学的层面探索黄芩苷、栀子苷、胆酸治疗中风的药理作用机制及异同,探索利用网络药理学研究中医药的方法。  方法:基于Pubchem数据库,用黄芩苷、栀子苷、胆酸的药效学相关信息干预前期研究中构建的来源于OMIM数据库中风疾病网络,应用Cytoscap软件将相关基因—蛋白质映射到中风疾病网络中整合对比,进行网络拓扑属性分析与模块化分析,并通过超几何分布检验统计进行GO功能富集分析比较模块功能。  结果:检索PubChem Compound发现与黄芩苷相关的基因10个,与栀子苷相关的基因一个,与胆酸相关的基因9个。分别构建了包含1120个节点,3928条边的黄芩苷-中风网络;1071个节点,3679条边栀子苷-中风网络;1095个节点,3760条边胆酸-中风网络。网络拓扑属性分析发现三个网络是无尺度网络。黄芩苷-中风网络划分为72个模块,栀子苷-中风网络中识别出82个模块,胆酸-中风网络中识别出83个模块。比较三个网络的模块的GO功能富集分析结果与中风网络的模块的GO功能富集分析结果发现,有9个与中风相关的生物学过程被黄芩苷所抑制,两个生物学过程被栀子苷所抑制,12个生物学过程被胆酸所抑制,9个生物学过程被胆酸所激活。  结论:黄芩苷治疗中风的主要途径是抑制白三烯的合成及白细胞毒作用,抑制单核细胞增殖和肿瘤坏死因子的产生,抑制细胞凋亡,调节蛋白质和不饱和脂肪酸的代谢等。栀子苷治疗中风的主要途径是抑制通过肾素-血管紧张素调节全身动脉血压和白细胞趋化。胆酸治疗中风的主要途径主要是抑制细胞形态分化及细胞外渗,抑制胆固醇的运输、储存,调节激素分泌,抑制细胞因子介导的信号通路,抑制含氮化合物的代谢过程,激活细胞表面受体的联系信号转导、中性粒细胞趋化、内皮细胞迁移,激活双氧水应答和血浆脂蛋白颗粒重塑等。

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