甘蓝型油菜TCP基因的全基因组分析及其中调控分枝发育基因的鉴定

目录

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第1章 文献综述

1.1.1 TCP基因的分类和特征

1.1.2 TCP基因的生物学功能

1.2.1分枝对植物株型和作物生产的影响

1.2.2 植物分枝的形成与调控机理

1.3 本研究目的和意义

第2章 油菜TCP基因家族的全基因组分析与调控分枝发育基因的筛选

2.1 前言

2.2 材料与方法

2.2.1 油菜TCP基因的鉴定

2.2.2 油菜TCP基因的系统发育分析

2.2.3 油菜TCP基因的结构、染色体定位和共线性分析

2.2.4 油菜TCP基因的启动子顺式作用元件和miRNA分析

2.2.5 油菜TCP蛋白的互作网络分析

2.2.6 油菜TCP基因的时空表达谱分析

2.3.1 BnTCPs基因的鉴定和系统发育分析

2.3.2 BnTCPs蛋白质的结构特征分析

2.3.3 BnTCPs基因的结构和miRNA靶位点预测

2.3.4 BnTCPs基因的启动子顺式作用元件分析

2.3.5 BnTCPs基因的染色体定位和共线性分析

2.3.6 BnTCPs蛋白质的互作网络解析

2.3.7 BnTCPs基因的时空表达谱分析

2.3.8 调控分枝发育TCP基因的鉴定

2.4 讨论与结论

第3章 陆地植物TCP基因家族的起源与进化

3.1 前言

3.2 材料与方法

3.2.1 TCP基因的鉴定及系统发育分析

3.2.2 TCP基因的miRNA靶向预测

3.2.3 TCP基因的表达谱分析

3.2.4 TCP蛋白的互作网络分析

3.3 结果与分析

3.3.1 TCP基因的鉴定和系统发育分析

3.3.2 TCP基因家族的起源与扩增机制

3.3.3 miR319在被子植物中保守地调控BnTCPs基因

3.3.4 陆地植物TCP基因的表达谱与功能

3.3.5 陆地植物TCP蛋白互作网络的保守与进化

3.4 讨论与结论

第4章 结 论

4.1 阐明了TCP基因家族在油菜中的进化机制和表达模式

4.2 探明了TCP基因家族在植物界中的起源和进化机制

4.3 初步筛选了5个可能调控油菜分枝发育的TCP基因

参考文献

致谢

硕士期间发表论文