猫疱疹病毒Ⅰ型感染细胞后microRNA表达谱分析及其调控Ⅰ型干扰素通路的研究

目录

声明

主要符号对照表

第一章 绪论

1.1.1 猫疱疹病毒Ⅰ型的病原学特性

1.1.2 猫疱疹病毒Ⅰ型的流行病学概况

1.1.4 猫疱疹病毒Ⅰ型的致病机理

1.1.6 猫疱疹病毒Ⅰ型的诊断

1.1.7 猫疱疹病毒Ⅰ型的治疗

1.1.8 猫疱疹病毒Ⅰ型的防控

1.2microRNA (miRNA)综述

1.2.1 miRNA的发现和产生

1.2.2 miRNA的作用机制

1.2.3 miRNA先天免疫中的调控作用

1.2.4 miRNA 与病毒的相互作用

1.2.5 疱疹病毒miRNA研究进展

1.3 目的和意义

第二章 FHV-1编码vmiRNA的预测与分析

2.1 材料和方法

2.1.1 毒株和细胞

2.1.2 试剂和耗材

2.1.3 仪器和设备

2.1.4 测序样品准备

2.1.5 测序

2.1.6 测序结果分析

2.1.7 FHV-1编码的vmiRNA验证

2.1.8 FHV-1编码的vmiRNA靶基因预测和分析

2.2 结果

2.2.1 测序数据质量评估

2.2.2 测序结果分类和注释

2.2.3 FHV-1编码的vmiRNA的预测和分析

2.2.4 FHV-1编码的vmiRNA的验证

2.2.5 FHV-1编码的vmiRNA靶基因的预测和分析

2.3 讨论

第三章 宿主miRNA表达谱的分析与鉴定

3.1 材料和方法

3.1.1 毒株、细胞

3.1.2 试剂和耗材

3.1.3 仪器和设备

3.1.4 测序样品准备及小RNA文库的构建

3.1.5 共有及特有序列分析

3.1.6 已知宿主miRNA表达谱分析

3.1.7 宿主miRNA的表达丰度分析

3.1.8 新miRNA的预测和碱基偏好性分析

3.1.9 差异表达的宿主miRNA分析

3.1.10 差异表达的宿主miRNA验证

3.1.11 差异表达的宿主miRNA靶基因预测和分析

3.1.12 宿主miRNA对FHV-1复制的影响

3.2 结果

3.2.1 共有及特有序列分析

3.2.2 已知宿主miRNA表达谱分析

3.2.3 宿主miRNA的表达丰度分析

3.2.4 新miRNA的预测和碱基偏好性分析

3.2.5 差异表达的宿主miRNA分析和验证

3.2.6 差异表达的宿主miRNA靶基因预测和分析

3.2.7 宿主miRNA对FHV-1复制的影响

3.3 讨论

第四章 miR-26a和miR-101抑制FHV-1复制

4.1 材料和方法

4.1.1 毒株、细胞和载体

4.1.2 试剂和耗材

4.1.3 仪器和设备

4.1.4 RNA提取

4.1.5 实时荧光定量PCR

4.1.6 miRNA和siRNA转染

4.1.7 病毒蚀斑实验

4.1.8绝对荧光定量PCR

4.1.9Western Blot检测

4.1.10 鼠源UL42多克隆抗体制备

4.1.11 microRNA靶基因预测及质粒构建

4.1.12 双荧光素酶报告实验

4.1.13 免疫荧光实验 (IFA)

4.1.14 FHV-1生长曲线的测定

4.1.15 统计学分析

4.2 结果

4.2.1 FHV-1感染引起miR-26a和miR-101表达上调

4.2.2 FHV-1感染通过cGAS介导的通路上调miR-26a和miR-101的表达

4.2.3 miR-26a和miR-101显著抑制病毒复制

4.2.4 miR-26a和miR-101增强JAK-STAT抗病毒信号通路

4.2.5 miR-26a和miR-101参与Ⅰ型干扰素的产生

4.2.6 miR-26a和miR-101靶向SOCS5基因

4.2.7 SOCS5表达量在FHV-1感染后显著降低

4.2.8 SOCS5抑制I型干扰素信号通路并促进FHV-1复制

4.2.9 miR-26a和miR-101通过调节SOCS5增强I型干扰素抗病毒信号

4.3 讨论

第五章 全文结论

参考文献

附录A

附录B

致谢

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