第一章 绪论
1.1引言
1.2南极及其资源
1.2.1南极生态系统
1.2.2南极冻融现象
1.2.3南极土壤微生物
1.3高通量测序技术
1.3.1扩增子测序
1.4有机碳对南极土壤微生物的影响
1.5 磷酸盐对南极土壤微生物的影响
1.6本课题研究思路和意义
1.6.1研究内容
1.6.2研究意义
第二章 南极菲尔德斯半岛可培养细菌和真菌的研究
2.1实验材料、试剂和仪器
2.1.1采样地点
2.1.2实验主要仪器和试剂
2.1.3培养基
2.1.4数据库以及分析软件
2.2研究步骤及方法
2.2.1土壤样品采集
2.2.2可培养细菌以及真菌的分离、纯化、保种
2.2.3可培养细菌和真菌的鉴定
2.3可培养细菌的实验结果
2.3.1可培养细菌统计计数和形态观察
2.3.2可培养细菌的序列分析和构建系统发育树
2.4可培养真菌的实验结果
2.4.1可培养真菌的统计计数与形态观察
2.4.2可培养真菌的鉴定和系统发育树的构建
2.5本章小结
第三章 16S高通量测序和南极土壤多样性分析
3.1材料与方法
3.1.1土壤样品
3.1.2试剂与设备
3.1.3生物信息学分析软件及数据库
3.2研究方法
3.2.1南极土壤样品理化性质测定
3.2.2土壤样品基因组 DNA 提取
3.2.3扩增子测序
3.3基太克湖融水成湖区细菌测序与分析
3.3.1基太克湖采样地点描述
3.3.2土壤理化性质结果
3.3.3 OTU聚类及物种注释概况
3.3.4细菌群落多样性和组成的分析
3.3.4α和β多样性分析
3.3.5组间差异物种LEfSe分析
3.3.6 环境因子和细菌群落的相关性分析
3.4半三点地区细菌测序与分析
3.4.1实验设计
3.4.2土壤理化性质
3.4.3 OTU聚类及物种注释概况
3.4.4细菌群落多样性和组成的分析
3.4.5α和β多样性分析
3.4.6β多样性分析
3.4.7 组间差异物种LEfSe分析
3.4.8环境因子和细菌群落的相关性分析
3.5本章小结
结论
参考文献
攻读学位期间的研究成果
致谢
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