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曲古抑菌素A处理乳腺癌细胞株SKBR-3的蛋白质组学分析

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目录

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1.引言

2.材料与方法

2.1细胞株来源

2.2药物来源

2.3主要试剂及仪器

2.4实验方法及步骤

2.4.1 细胞株SKBR-3培养

2.4.2 药物稀释及存储浓度

2.4.3 药物作用浓度及处理方法

2.4.4 样品质控检测

2.4.5 蛋白质的提取

2.4.6 胰蛋白酶酶解

2.4.7 串联质谱(TMT)标记

2.4.8 HPLC分级

2.4.9 LC-MS分析

2.4.11 质谱质控检测

2.4.12生物信息学分析

3.结果

3.1样品质控结果

3.1.1蛋白浓度测定结果

3.1.2 SDS-PAGE电泳

3.2鉴定所得总蛋白及差异蛋白

3.3差异蛋白的GO注释

3.3.1 GO注释分类

3.4差异蛋白功能富集分析

3.4.1 GO富集

3.4.2 KEGG 通路富集

3.5基于蛋白质功能富集的聚类分析

4.讨论

5.结论

参考文献

致谢

附录

附录A 中英文缩略词表

附录B 个人简历及攻读学位期间发表文章情况

附录C 课题综述:组蛋白去乙酰化酶抑制剂:乳腺癌治疗的新策略

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