大豆慢生根瘤菌和豇豆根瘤菌的遗传多样性和系统发育的研究

摘要

通过16S rRNA PCR-RFLP，16S rRNA序列分析，16S-23S rRNA PCR-RFLP和富含G-C的RAPD技术对分离自中国主要大豆产区的44株慢生根瘤菌进行遗传多样性和系统发育的研究。16S rRNAPCR-RFLP，16S rRNA序列分析表明：供试菌株和代表菌株可以分为4种基因型，基因型I包括18株分离自北方的菌株，他们与慢生根瘤菌B．japnicum，B．liaoningense和B．elkanii．代表菌株的基因型均有差别。基因型II有23株，其基因型与除了USDA6的所有B．japonicum的代表菌株以及B．liaoningense．的代表菌株都一样。基因型III单独包括B．japonicum的代表菌株LISDA6。基因型IV包括3株供试菌株以及R．elkanii，的代表菌株。16S rRNA序列分析表明HAS5与B．elkanii的代表菌株聚在一起，其与代表菌株LISDA76的序列差异为0.4％。DD3，BQ3，GXDl，JZ2与其它所有B．japonicum的代表菌株归为一大类，有很高的同源性，其序列差异均小于1％。16S-23S rRNA PCR-RFLP分析表明：群I为16S rRNA RFLP分析的基因型I的菌株；16S rRNA PCR-RFLP分析中的基因型II的菌株在16S-23S rRNA PCR-RFLP分析中分为群II和群III，群II包括B．liaoningense和部分基因型II的菌株，群III包括B．7apnonicum和基因型II剩余的部分菌株，大部分来自长江流域；群Ⅳ由3株来自红安的菌株以及最elkanii．组成。RAPD分析表明供试菌株和代表菌株在72％的相似水平上同样分为I、II、IⅡ、Ⅳ四个群，与16S-23S rRNA PCR-RFLP分析一致。其在更高的相似水平上分群更加细化，反映地理因素对分群的重要影响。 通过16S rRNA PCR-RFLP，16S rRNA序列分析，16S-23S rRNAPCR RFLP和富含G-C的RAPD等技术对分离自中国55株豇豆根瘤菌和进行遗传多样性和系统发育的研究。16S rRNA PCR-RFLP，16S rRNA序列分析表明：供试菌株和代表菌株分为6种基因型，属于慢生根瘤菌的包括基因型I、基因型II、基因型III，共48株。其中基因型I有16株菌株，与B．japonicum和B．liaoningense基因型完全相同；基因型II包括25株与B．japonicum和B．liaoningense以及B．elkani均有差异；基因型Ⅲ有7株菌株与B．elkani基因型完全相同的。属于快生根瘤菌的包括基因型IV、基因型V、基因型VI，其中基因型Ⅳ有一株DdE4与豌豆根瘤菌的基因型完全相同；基因型V有4株与费氏中华根瘤菌完全相同；基因型VI有两株与费氏中华根瘤菌略有差异，各基因型的供试菌株与参比菌株的序列差异均小于1％。16S-23SrRNA PCR-RFLP分析表明：供试菌株有48株为慢生根瘤菌，7株为快生根瘤菌。慢生根瘤菌在80％的相似水平上分为I，II，III和Ⅳ群，I群有30株；II群包括5株供试菌株和大豆慢生根瘤菌B．japonicum；群III包括6株供试菌株和辽宁慢生根瘤菌B．liaoningense；群IV包括7株供试菌株和埃氏慢生根瘤菌B．elkanii．的代表菌株；群V包括6株供试菌株和费氏中华根瘤菌USDA205；群Ⅵ包括DdE4和豌豆根瘤菌R leguminosarum的代表菌株USDA2370。群Ⅳ、群Ⅴ、群Ⅵ与16SrRNA的RFLP分析一致，其它群略有差别。RAPD分析表明：供试菌株和代表菌株分为6群，其中群Ⅳ、群Ⅴ和群Ⅵ与16.23SrRNARFLP的分析一致。其它群略有差别。表现出丰富的遗传多样性和DNA进化过程中的趋异性。

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1文献综述

2.研究的目的和意义

3材料与方法

4结果与分析

5.讨论

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