甘肃河西走廊地区锦鸡儿的SSR分析

摘要

锦鸡儿是豆科锦鸡儿属多年生灌木植物，具有很高的饲用和药用等价值，是防风固沙的先锋植物。本研究结合具体的研究条件，采用SSR分子标记技术对来自甘肃河西走廊地区的14种锦鸡儿进行遗传多样性分析和聚类比较，旨在锦鸡儿的遗传育种研究提供必要的依据。研究结果如下： 　　1.在利用SSR技术研究锦鸡儿遗传多样性过程中，从引物筛选、扩增条件、检测方法等几个方面进行优化，建立锦鸡儿SSR最适合的反应体系为：10μL的PCR反应体系：模板DNA20ng/μL,引物浓度为1.5μmol/L，dNTP浓度为0.20mmol/L，Mg2+浓度为2.0mmol/L，TaqDNA聚合酶为1U。SSR的PCR扩增条件为：95℃预变性3 min，94℃变性30 s，53℃退火1min，72℃延伸1min，共30个循环，72℃延伸10min。cpSSR的PCR扩增条件为：94℃预变性3 min，94℃变性30 s，54℃退火11Os，72℃延伸1min，共30个循环，72℃延伸8min。在此优化体系下，可以得到重复性好、稳定且多态性高的SSR条带。 　　2.从66对SSR大豆引物中筛选出9对多态性SSR引物，引物多态率为13.64％。从40对叶绿体SSR(epSSR)大豆引物筛选出10对cpSSR多态性引物，引物多态率为25％。9对SSR引物共检测到109个等位变异，平均每个引物检测到11个等位变异。引物等位位点多态性信息量PIC变幅在0.320～0.921之间，平均为0.738。Shannon指数变幅在0.246～0.486之间，平均为0.342。10对叶绿体SSR共检测到92个等位变异，平均每个引物检测到9个等位变异。引物等位位点多态性信息量PIC变幅在0.512～0.865之间，平均为0.671。Shannon指数变幅在0.308～0.500之间，平均为0.444。 　　3.14种锦鸡儿间的Nel’s遗传相似系数(Gs)在0.60～0.92之间，平均GS为0.76。14种锦鸡儿的遗传相似性变幅大，种闯的遗传相似性依物种的变化而各异，存在着不同程度的遗传差异。 　　4.利用NTSYSpc 2.1对SSR和cpSSR数据聚类分析，构建了锦鸡儿的UPGMA系统树，以遗传相似系数为GS 0.73为闽值将14种锦鸡儿划分为5大类群6个亚类。SSR和cpSSR所分析的种间遗传关系与传统的分类结果基本一致。

目录

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论文说明：缩略词(Abbreviation)

声明

第一章文献综述

1.锦鸡儿种质资源的分类

2.我国锦鸡儿种质资源分布现状

3.锦鸡儿种质资源研究现状

3.1地理分布的研究

3.2解剖学研究

3.3花粉学研究

3.4细胞学研究

3.5生态学研究

3.6药物化学研究

3.7油料学研究

3.8分子生物学研究

4.遗传多样性研究的方法及其应用

4.1遗传多样性的概念

4.2遗传多样性的研究方法

4.3遗传多样性的研究意义

5.遗传标记

5.1形态学标记

5.2细胞学标记

5.3生化标记

5.4分子标记

6.分子标记技术的应用

6.1基因连锁图

6.2基因定位

6.3品种鉴定及其指纹图谱绘制

6.4分子标记辅助育种

7.研究意义与展望

第二章材料与方法

1.采样地自然概况

2.供试材料

3.仪器及试剂

3.1主要仪器

3.2主要试剂

4.实验方法

4.1 DNA提取方法

4.2 DNA的检测

4.3 SSR体系优化

4.4 PCR扩增产物的电泳检测

4.5数据统计与分析

第三章结果与分析

1.14种锦鸡儿DNA的SSR和cpSSR的多态性

2.遗传差异

3.14种锦鸡儿的聚类分析与亲缘关系

第四章结果与讨论

1.讨论

2.结论

致谢

参考文献

附 录

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