三倍体胚乳性状遗传模型的上位性分析

摘要

上位性概念被引入遗传学领域近100年了，在理解遗传变异和遗传育种中的英应用也越来越重要!在选择理论中，越来越多的证据表明加加上位性能稳定遗传到下一代。但是在经典数量遗传研究中，双列杂交做为常用工具被用于研究诸多农艺性状和种子性状的遗传背景，而上位性常常被忽略。研究者通过基于表形或一般的基因型人工选择来提高性状的产量以及改良性状的品质，例如水稻的产量和品质。在经典数量遗产学领域，育种者往往通过双列杂交来理解数量性状(包括农艺性状，种子性状等)的遗传背景。 在我们的研究中，也基于双列杂交体系提出了一个遗传模型来分析三被体胚乳性状的直接和母体上位性效应，直接加性、显性效应，细胞质效应，以及母体加性和显性效应。并运用混合线形模型来分析该遗传模型。我们用最小范数二阶无偏估算法(MINQUE)来估算单性状的方差分量和性状间的协方差分量，通过设定参数的先验值为1(MINQUE(1))。随机效应值通过执行调整无偏预测法(AUP)得到。并运用刀切法来得到估算参数分布的参数，即方差和标准差，并通过一维t测验来检验参数的变异(方差)，二维t测验来检验性状间的相关性(协方差)和随机效应值。 蒙特卡罗模拟被应用来检测遗传参数的估算和模型的稳定性。模拟分析同时应用于双列杂交的平衡设计和非平衡设计。模拟结果显示在估算单性状的方差和性状间的协方差时，平衡设计和非平衡设计没有显著的差异。并且加加上位变异能被显著的检测出来，其模拟的功效值接近1。当直接加性效应不存在变异的情况下，加加上位变异也能被显著的检测出来。 在本研究中，我们也通过估算实际水稻种子性状的数据，说明了在经典数量遗传研究中，加加上位变异的分析是可行的。结果也显示直接加性不存在变异，而直接加加上位和母体加加上位的变异却是最重要的。该结果也说明了，在实际育种过程中，考虑加加上位变异而得到的遗传率和育种值会更精确。

目录

摘要

Acknowledgements

Chapter 1 Introduction and Literature Review

Chapter 2 Construction of the Genetic Model

Chapter 3 Methods for Diallel Cross Analysis

Chapter 4 Simulation Analysis for Diallel Cross

Chapter 5 Worked Example of Diallel Cross for Rice Seed Traits: WBR and WMR

Chapter 6 Discussion

SUMMARY

SOFTW ARE DESCRIPTION

REFERENCES