新疆卡波氏肉瘤组织内人类疱疹病毒8型K1基因型的分析

摘要

目的：了解新疆卡波氏肉瘤(Kaposi’s Sarcoma, KS)患者中人类疱疹病毒8型（human herpesvirus 8, HHV-8)基因型特征及分布情况，并初步探索其与KS临床特征可能的相关性和演变特点。方法：对11例本地KS冰冻标本进行组织基因组DNA抽提，以β-actin为内参进行基因组DNA质量鉴定，应用巢氏PCR扩增K1基因，并将K1基因PCR产物纯化。双向测序后运用 DNAMAN、Mega3.0软件、phylip23.63等生物信息学软件及程序对 HHV-8 DNA 序列进行了编辑、翻译、氨基酸序列比对以及绘制系统进化树和系统发生学分析，确定HHV-8基因型和分布特征。结果：11例本地的KS标本中A、C基因型分别为3和8例，其中A5和C7亚型是国内首次分离出。基因型分布呈成簇聚集和来源一致的特点。AIDS-KS和经典型KS临床表现不同但HHV-8基因型可一致。结论：新疆KS患者HHV-8基因型以A和C为主，并出现A5和C7亚型，与非洲和欧洲来源毒株的同源性很高, 可能与本地少数民族种族起源相关。本研究初步提示HHV-8基因型与病灶分布和形态、病程及HIV协同感染等临床信息有相关性趋势，由于纳入标本较少，仅有构成比差异，因此上述结论需要进一步扩大样本量予以确证。

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综述 人类疱疹病毒8 型基因型的研究进展

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