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海岛棉抗枯萎病性的遗传分析及遗传连锁图谱加密

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第1章 绪论

1.1 棉花枯萎病研究进展

1.2 棉花分子标记的研究

1.3 棉花遗传连锁图谱构建

1.4 棉花QTL定位研究

1.5 新疆海岛棉育种现状以及抗病育种展望

1.6 本研究的目的与意义

第2章 海岛棉枯萎病抗性遗传分析

2.1 试验材料与方法

2.2 结果与分析

2.3 讨论

2.4 结论

第3章 海海杂交枯萎病遗传图谱的加密

3.1 材料与方法

3.2 结果与分析

3.3 讨论

3.4 结论

第4章 遗传图谱加密效果的应用-QTL的重定位

4.1 试验材料与方法

4.2 结果与分析

4.3 海岛棉枯萎病基因间遗传连锁分析的验证BSA法

4.4 讨论

4.5 结论

第5章 全文结论

附录

参考文献

致谢

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摘要

发展高密度的遗传连锁图谱对于棉花这种重要的经济作物而言具有重要的意义。本试验就是在课题组前期构建的遗传图谱以及借助F2田间抗病性调查进行抗病QTL初步定位的基础上,继续探索海岛棉枯萎病的抗性遗传,增加标记以期实现遗传图谱的加密,并在加密的图谱上结合田间的后续世代的田间病情调查,进行抗病性QTL重定位。本试验的研究主要包括以下几个方面:
  1.以海岛棉抗病材料06-146和海岛棉感病材料新海14的杂交群体,考察该群体的亲本,F1以及F2~F2:5代,借助显著性分析得到了海岛棉枯萎病病害对农艺性状和产量的影响,结果显示,随着海岛棉枯萎病病级的增加,株高、果枝数等农艺性状有减少的趋势,并且与反应产量相关的指标有明显的下降趋势。反映了海岛棉枯萎病的致萎缩、减产的危害。
  2.运用相关性和主成分分析,得到了影响海岛棉产量因素的相关性以及在海岛棉增产中所起的作用。结果显示海岛棉产量与单株成铃数和单铃重呈显著的正相关,同时显示海岛棉产量与海岛棉枯萎病病级呈显著的负相关,而且枯萎病病级还与那些与海岛棉产量呈正相关的指标比如果枝数和株高呈负相关,也反应出,枯萎病对海岛棉具有减产的作用。
  3.遗传力分析得出单株成铃数和单铃重的遗传力低,适宜在后期世代中选择,枯萎病的遗传力中等,适宜在中后期世代选择。
  4.运用365对引物,对亲本进行筛选,共得到157对多态性引物,对F2群体遗传连锁图谱构建整合,构建了一个全长为872cM,包含的标记数为67个,平均遗传距离为13cM的图谱。覆盖海岛棉基因组9条染色体,较之之前的遗传图谱,其中的3、5、8、12、16、18、25、26号染色体被再次定位,验证了之前结果的可靠性。另外的1号未被定位出,新定位20号染色体。每条染色体上的连锁群数发生一定的变化。26号染色体由之前的一个连锁群,增加到2个。16号染色体由原来的一个连锁群增加到两个,两个连锁群的标记数也与之前定位到16号染色体上的标记一致。
  5.利用WinQTLCartV2.0软件,采用复合区间作图法进行抗病性QTL定位,LOD值为2.5,共检测到8个可能的QTLs,分别位于LG1(Chr.16)、LG5(Chr.26)、LG8(Chr.3)、LG10(Chr.8)、LG11(Chr.12)。定位在3号染色体上的种植在阿拉尔的F2:5群体成株期的贡献率为10.88%,定位在16号染色体上的阿拉尔F2:5剖杆和库尔勒F2:4成株,贡献率分别为:21.73%、20.25%,定位在26号染色体上的库尔勒F2:4剖杆贡献率为69.01%,定位在8号染色体上的库尔勒F2:4剖杆贡献率为67.53%,定位在12号染色体上的库尔勒F2:4剖杆、库尔勒F2:5成株和剖杆,贡献率分别为:61.42%、61.42%和34.33%。由表4-2可知qFw4、qFw5、qFw6、qFw7是主效基因。由于其加性效应值均为负值,说明其增效等位基因来自抗病亲本,因而在分子标记辅助育种中具有利用价值。

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