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基于SSR分子标记棉花品种DNA指纹图谱构建的研究

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摘要

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第1章 引言

1.1 我国棉花的种植情况

1.2 棉花育种技术的研究进展

1.3 SSR分子标记技术

1.4 棉花种子质量检测

第2章 引物的初步筛选

2.1 材料与试剂

2.2 实验方法

2.3 结果与分析

2.4 讨论

第3章 初筛引物的检测

3.1 材料与方法

3.2 结果与分析

3.3 讨论

第4章 20份棉花品种指纹图谱的构建

4.1 材料与方法

4.2 结果与分析

4.3 讨论

第5章 核心引物的应用

5.1 材料与方法

5.2 结果与分析

5.3 讨论

第6章 结论

附录

参考文献

致谢

作者简历

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摘要

棉花是我国重要的经济作物之一,与经济发展和人民生活水平息息相关。由于分子技术的高速发展,棉花育种技术也迎来空前发展。分子标记作为第四大遗传标记以其独特的优点受到各个领域的高度关注,在各种农作物、动物以及人体上得到了广泛应用。简单序列重复(Simple Sequence Repeats,简称SSR)被认为是目前构建指纹图谱的首选标记,目前已有多种植物以SSR分子标记方法构建了相应的指纹图谱,为品种纯度和真伪性鉴定提供理论依据,也为分子育种过程中亲本的选育提供参考。本研究主要结论如下:
  1.综合大量文献及实验室前人研究确定700多对SSR引物,利用12份筛选材料对其进行检测,选出表现多态性的SSR引物291对,作为核心引物的备选引物
  2.利用两对杂交种和一个F2群体,对初步筛选的291对引物进行可行性检测,两对杂交种及其亲本各选出8对和7对表现为共显性的引物;利用F2的父母本从291对引物中选出62对在亲本间表现差异的引物,利用这些引物对F2群体进行连锁分析,依据分子标记结果构建了10个连锁群,连锁群全长为1039.32 cM,覆盖棉花基因组的20.78%,标记间的平均距离为20.38 cM。
  3.从291对SSR引物中最终确定15对核心引物构建20份棉花品种的DNA指纹图谱,15对核心引物共检测到57种基因型,平均每对引物检测到的基因型数为3.8个,变幅为2~12;多态信息含量(Polymorphism Information Content,简称PIC)值介于0.7308~0.9571,平均值为0.8782;构建的指纹图谱能完全将20份材料逐一鉴别。
  4.利用筛选的15对核心引物对棉花进行纯度和真实性鉴定,4份待测样品的纯度依次为95%、88.89%、100%、93.33%,选用15对引物中的14对引物构建了14份棉花的指纹图谱,分析结果显示14份材料间的遗传相似系数变幅为0.4235~0.9529,平均为0.7776,说明筛选的核心引物可应用于其他品种纯度和真实性鉴定研究。

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