中国美利奴羊（新疆型）KRT85、Notch2和ADAM9基因对毛性状的遗传效应研究

摘要

本研究以中国美利奴羊（新疆型）为材料，运用PCR-SSCP技术对KRT85、Notch2和ADAM9候选基因的SNPs进行基因型分型，采用SAS9.1最小二乘方法分析SNPs与毛性状关联性。旨在得到相应的分子遗传信息，获取与毛性状的相关的DNA标记，为中国美利奴羊（新疆型）遗传资源的保护、开发和利用奠定基础，改善与提高绵羊生产性能，以便为细毛羊分子育种提供理论依据。主要研究结果如下:
　　1.利用DNA池检测与细毛羊毛性状相关SNPs
　　利用重测序技术对两个极细和极粗的DNA池中筛选出与毛性状相关的SNPs: KRT85基因筛选出2个SNPs，Notch2基因筛选出2个SNPs，ADAM9基因基因筛选出1个SNP，共5个显著的SNPs标记。
　　2.KRT85、Notch2和ADAM9基因的多态性检测
　　通过PCR-SSCP技术对基因分型，KRT85-1和ADAM9位点得到AA、AB和BB3种基因型，KRT85-2、Notch2-1、Notch2-2位点得到AA和AB型2种基因型。5个位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P＞0.01）。KRT85-1位点遗传变异处于低等水平，KRT85-2、Notch2-1、Notch2-2、ADAM9位点遗传变异处于中等水平。测序结果显示KRT85-1基因位点测到2处突变，即133 bpA/C、46bp-/A;KRT85-2基因位点检测到5处突变、89bpG/A、188bpG/A、196bpA/T、190bpA/C、137bpG/A; Notch2-1基因检测到4处突变，即34bpA/-、35bpC/A、46 bpA/-、132bpG/C; Notch2-2基因位点检测到5处突变，即54bpC/T、162bpG/A、166bpC/A、167bpA/T、55bpA/-; ADAM9-1基因位点检测到2处突变，即78bpG/C、35bpA/-。
　　3.KRT85、Notch2和ADAM9基因与中国美利奴羊（新疆型）毛性状的关联分析
　　用SAS9.1对KRT85、Notch2和ADAM9基因与毛性状的GLM分析，结果显示，KRT85-1不同基因型对中国美利奴羊（新疆型）母羊弯曲数有显著影响(P＜0.05)。KRT85-2基因位点对体格大小、体格外貌评分、鉴定时体重、校正后鉴定时体重、等级有显著影响(P＜0.05)。Notch2-1对鉴定时体重、毛长、体格大小有极显著影响(P＜0.01)，Notch2-2对弯曲数有极显著影响（P＜0.01）。ADAM9不同基因型对剪毛量有显著影响(P＜0.05)。

目录

声明

摘要

第1章 绪论

1．1 中国美利奴羊(新疆型)的品种

1．2 国内外细毛羊的发展趋势

1．3 羊毛结构的研究情况

1．4 Notch信号通路以及相关基因

1．5 ADAM9基因的研究

1．6 单核苷酸多态性概念及特点

1．7 本研究的目的与意义

第2章 材料与方法

2．1 试验材料

2．2 主要仪器设备

2．3 试剂盒及普通试剂

2．4 试验方法

2．5 构建TruSeq DNA文库

2．6 数据统计与分析

第3章 结果与分析

3．1 重测序结果筛选

3．2 基因组DNA提取结果

3．3 Notch2-1基因的多态性及其与羊毛性状的关系

3．4 Notch2-2基因的遗传多态性分析及与毛性状的关系

3．5 KRT85-1位点基因的多态性及其与羊毛性状的关系

3．6 KRT85-2位点基因的多态性及其与羊毛性状的关系

3．7 ADAM9基因的多态性及其与羊毛性状的关系

3．8 KRT85与Notch2基因位点不同基因型的组合效应与羊毛性状的关联性

第4章 讨论

4．1 KRT基因作为毛用候选基因的可能性

4．2 KRT基因的遗传多态性分析

4．3 ADAM家族与Notch受体的关系

4．4 KRT、Notch2、ADAM9基因与毛性状之间的关联性

4．5 KRT85与Notch2不同的基因位点的基因型组合效应与羊毛性状的关系

第5章 结论

参考文献

致谢

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