西藏绒山羊β-catenin、BMP4、Noggin基因序列、遗传多样性及mRNA表达分析

摘要

西藏绒山羊羊绒品质远优于其他地区绒山羊品种，但其目前的羊绒产量远不能满足广大消费者的需求，因此，提高西藏绒山羊羊绒产量显得越来越迫切。目前的研究已经证明β-catenin、BMP4、Noggin基因是调控毛发生长的关键基因，但这三个基因的基因序列、遗传多样性及mRNA表达在西藏绒山羊的研究中未见相关报道。
　　本试验以不同地区的210只西藏绒山羊作为研究对象，扩增了西藏绒山羊β-catenin、BMP4、Noggin基因的CDS区，对其编码外显子的遗传多样性进行了分析，进而检测了西藏绒山羊β-catenin、BMP4、Nggin基因的mRNA表达水平。
　　取得的主要结果如下:
　　1、西藏绒山羊β-catenin基因CDS全长2346bp，编码781个氨基酸;BMP4基因CDS全长1230bp，编码409个氨基酸;Noggin基因CDS全长699bp，编码232个氨基酸。这三个基因与哺乳动物的氨基酸序列相似性均在97.79％以上。进化树分析显示，西藏绒山羊与山羊、绵羊、牛的亲缘关系较为接近，与非洲爪蟾、斑马鱼的亲缘关系最远。
　　2、成功扩增出β-catenin基因的14个编码外显子，BMP4基因的3个编码外显子和Noggin基因的1个编码外显子。扩增测序未在BMP4基因编码外显子2及Noggin基因编码外显子1中发现SNP位点，β-catenin基因中发现5个SNP位点，且在5个SNP位点中c.621C＞T、c.1491C＞T、c.63C＞T位点杂合度较高，c.687G＞A，c.1140C＞T位点杂合度较低，群体遗传学分析发现5个SNP位点都符合符合哈迪-温伯格平衡定律（P＞0.05），结果表明这5个SNP位点都能稳定遗传，且c.621C＞T、c.1491C＞T、c.63C＞T位点更具研究潜力。5个SNP位点在6个县中的杂合度与产绒量分析显示c.63C＞T、c.621C＞T和c.687G＞A位点可能与产绒量呈正相关，而c.1140C＞T和c.1491C＞T位点可能与产绒量呈负相关。
　　3、mRNA表达分析显示革吉县的β-catenin基因表达量显著高于其他县（P＜0.05），改则县和革吉县的BMP4基因表达量显著高于其他县（P＜0.05），6个县之间Noggin基因表达量没有显著差异(P＞0.05)，结合产绒量分析表明BMP4基因的表达可能抑制绒毛生长，而β-catenin基因和Noggin基因的与绒毛生长的关系还不清楚。β-catenin基因4个SNP位点不同基因型的mRNA表达分析显示β-catenin基因的基因型可能会影响其表达量的高低。
　　上述研究结果为进一步深入了解西藏绒山羊这一地方特色品种β-catenin、BMP4和Noggin基因的分子特性积累了宝贵的基础资料，为以后培育更高绒产量的西藏绒山羊品种奠定了重要的基础。

目录

声明

摘要

常用缩略语中英文对照表

第一章文献综述

2．1 β-catenin基因概述

2．2 BMP4基因概述

2．3 Noggin基因概述

3单核苷酸多态性概述

3．1 SNP的检测方法

3．2 SNP的研究进展

4本研究的目的及意义

第二章西藏绒山羊β-catenin、BMP4、Noggin基因序列、遗传多样性及mRNA表达分析

1材料与方法

1．1材料

1．2方法

2结果

2．1西藏绒山羊β-catenin、BMP4、Noggin基因CDS扩增及序列分析

2．2编码外显子扩增测序及遗传多样性分析

2．3西藏绒山羊β-catenin、BMP4、Noggin基因mRNA表达量分析

3讨论

3．3 β-catenin、BMP4、Noggin基因mRNA表达量分析

4结论

参考文献

致谢