野猪群体结构基因遗传共适应特性的研究

摘要

群体基因库的遗传共适应特性是在系统演化过程中逐渐形成的，和各基因位点的基因频率一样，是基因库属性的一个方面。对吉林、黑龙江、辽宁三省的东北野猪进行随机采样，共采取野猪组织样本42个，利用PCR-SSCP和PCR-RFLP技术对其Nanong、Leptin、胰岛素样生长因子蛋白3、JAK2、肠毒素大肠杆菌受体、心脏脂肪酸结合蛋白、钙蛋白酶抑制蛋白、组织蛋白酶D、成骨细胞特异因子、白色位点(KIT基因)、肌细胞生成素、垂体转录因子、MRAMP1、乳铁蛋白、运铁蛋白15个结构基因位点进行了多态性检测，并对多态性基因位点进行了群体遗传共适应性分析，获得了如下结果： 1．15个结构基因位点中，有Nanog、Leptin、胰岛素样生长因子蛋白3、JAK2、肠毒素大肠杆菌受体、心脏脂肪酸结合蛋白、钙蛋白酶抑制蛋白7个基因位点存在不同程度的多态性，多态性比例为46.67％。 2．7个多态性基因位点中，有JAK2、肠毒素大肠杆菌受体、心脏脂肪酸结合蛋白、钙蛋白酶抑制蛋白4个处于遗传不平衡状态，占所检测多态性基因位点的57.14％。 3．位于不同染色体上的基因位点之间的18个组合中有Nanog-JAK2、JAK2-Leptin、JAK2-IGFBP-3、JAK2-CAST、JAK2一H-FABP、JAK2-ECF18R 6个组合处于遗传不平衡状态，其主要原因是遗传共适应的作用，而且起主要作用的是JAK2基因。 4．位于同一条染色体上的三个基因位点之间的3个组合都处于遗传平衡状态，但是Leptin-ECF18R组合处于连锁不平衡状态，这是因为遗传共适应和基因间的连锁作用的方向是相反的，两者共同作用使得两位点处于遗传平衡状态。

目录

文摘

英文文摘

声明

前言

1文献综述

1.1野猪资源现状

1.2遗传共适应性的研究现状

1.2.1遗传共适应问题的由来及概念的提出

1.2.2遗传共适应数学模型的建立与发展

1.2.3动物群体遗传共适应的研究进展

1.2.4遗传共适应研究目前存在的问题

1.3有关结构基因位点研究进展

1.3.1 Nanog基因

1.3.2 Leptin基因

1.3.3胰岛素样生长因子蛋白3基因(IGFBP3)

1.3.4 JAK2基因

1.3.5肠毒素大肠杆菌受体基因(ECF18R)

1.3.6心脏脂肪酸结合蛋白基因(H-FABP)

1.3.7钙蛋白酶抑制蛋白基因(CAST)

1.3.8组织蛋白酶D基因(CTSD)

1.3.9成骨细胞特异因子基因(POSTN)

1.3.10白色位点(KIT基因)

1.3.11肌细胞生成素基因(Myostatin,又名GDF-8)

1.3.12垂体转录因子基因(Pit-1)

1.3.13NRAMP1基因

1.3.14乳铁蛋白基因(LTF)

1.3.15运铁蛋白基因(TF)

2材料与方法

2.1试验材料

2.1.1试验猪种的来源及采样方法

2.1.2仪器设备

2.1.3试验试剂

2.2试验方法

2.2.1组织DNA的提取

2.2.2 DNA质量的检测

2.2.3 DNA的纯化

2.2.4限制性片段长度多态性DNA标记分析

2.2.5单链构象多态性DNA标记分析

2.3数据统计及分析方法

2.3.1基因型频率和基因频率

2.3.2群体遗传平衡性检验

2.3.3群体遗传共适应系数的计算

3结果与分析

3.1组织中DNA的提取与检测

3.2野猪六个基因位点的PCR-RFLP检测结果

3.2.1 JAK2基因

3.2.2肠毒素大肠杆菌受体基因(ECF18R)

3.2.3心脏脂肪酸结合蛋白基因(H-FABP)

3.2.4钙蛋白酶抑制蛋白基因(CAST)

3.2.5未检测到多态性的基因

3.3野猪九个基因位点的PCR-SSCP检测结果

3.3.1 Nanog基因

3.3.2 Leptin基因

3.3.3胰岛素样生长因子蛋白3基因(IGFBP3)

3.3.4未检测到多态性的基因

3.4数据统计与分析

3.4.1单个基因位点的遗传平衡检验

3.4.2两个基因位点间组合的遗传平衡检测

3.4.3连锁不平衡检测及遗传共适应系数的计算结果

4讨论

4.1限制性片段长度多态性与单链构象多态性DNA标记分析

4.1.1限制性片段长度多态性DNA标记分析

4.1.2单链构象多态性DNA标记分析

4.2遗传共适应产生的背景及应用

4.3遗传不平衡原因分析

4.4遗传共适应存在的主要问题

5结论

参考文献

致谢

研究生在校期间论文发表情况