山西人群MTHFD1、MTR基因多态性与非综合征性唇腭裂相关性的核心家系研究

摘要

非综合征性唇腭裂(Non-syndromiccleftlipwithorwithoutcleftpalate，NSCL/P)是人类最常见的先天畸形之一，发病机制目前还不明确，学界普遍认为NSCL/P是一种多基因复杂遗传疾病，近年来的研究结果显示许多基因和NSCL/P的发生有关。
　　近年来研究显示母亲孕期增补叶酸可以降低非综合征性唇腭裂唇腭裂的发生，叶酸代谢相关基因成为目前非综合征性唇腭裂研究的热门候选基因，亚甲基四氢叶酸脱氢酶1（Methylenetetrahydrofolate-dehyd-rogenase1，MTHFD1）在叶酸代谢过程中催化三个连续的反应，其基因多态性可能会导致NSCL/P的发生；蛋氨酸合成酶(methioninesynthase,MTR/MS)是蛋氨酸代谢循环中的一个关键酶，其活性下降可能会使血液中的高半胱氨酸水平升高，影响DNA的甲基化，诱发NSCL/P。
　　本次研究通过对山西人群135个NSCL/P核心家系和150例正常新生儿及其母亲MTHFD1基因rs2236225位点和MTR基因rs1805087位点多态性进行检测，从人群关联研究和核心家系分析两方面探讨这两个位点多态性与NSCL/P的相关性。
　　目的：研究MTHFD1基因rs2236225位点和MTR基因rs1805087位点单核苷酸多态性与山西人群NSCL/P的相关性。
　　方法：收集135个非综合征性唇腭裂核心家系外周静脉血、150例正常新生儿脐带组织及其母亲外周静脉血，提取所有标本DNA，采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法对所有标本MTHFD1基因rs2236225位点和MTR基因rs1805087位点的多态性进行检测；Pearsonχ2检验人群基因型分布是否符合HWE（Hardy-WeinbergEquilibrium，哈迪-韦恩伯格平衡），用人群关联研究，病例组核心家庭的传递不平衡检验（transmissiondisequilibriumtest，TDT）和单体型的相对危险度（haplotype-basedhaplotyperelativerisk，HHRR）进行统计分析。
　　结果：MTHFD1基因rs2236225位点：病例组与对照组相比较，子代和母亲的基因型分布差异无统计学意义(P>0.05)，但是子代等位基因频率差异有统计学意义(P<0.05)；按唇腭裂类型分层后，唇裂组中子代基因型分布差异无统计学意义(P>0.05)，基因型频率比较差异有统计学意义(P<0.05)。唇腭裂组中，子代的基因型分布及等位基因频率比较差异均无统计学意义(P>0.05)。传递不平衡检验提示，rs2236225位点突变A等位基因在NSCL/P核心家庭中存在传递失衡(χ2=11.88，P<0.05)；HHRR检验χ2=16.48，P=0.00，OR=2.101，95％CI:1.465-3.014。
　　MTR基因rs1805087位点：本研究中GG基因型较少，故将AG和GG基因型合并后与AA比较，子代及母亲病例组和对照组之间基因型分布和等位基因频率比较差异均无统计学意义(P>0.05)；唇裂组和唇腭裂组子代及母亲基因型分布和等位基因频率与对照组差异均无统计学意义(P>0.05)；病例组核心家庭分析，TDT检验χ2=0.083，P>0.05，HHRR分析χ2=0.112，P>0.05,说明携带有突变基因G并不能增加NSCL/P的发病风险。
　　结论：本次研究发现MTHFD1基因rs2236225位点多态性与山西人群非综合征性唇腭裂的发生存在关联；未显示MTR基因rs1805087位点多态性与山西人群非综合征性唇腭裂的相关性。

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前言

第一部分 MTHFD1基因rs2236225位点多态性与非综合征性唇腭裂相关性的核心家系研究

第一章 材料和方法

第二章 结果

第三章讨论

第四章结论

第二部分 MTR基因rs1805087位点多态性与非综合征性唇腭裂相关性的核心家系研究

第一章 材料和方法

第二章结果

第三章 讨论

第四章 结论

参考文献

综述

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