胶州湾浮游植物分子遗传多样性研究

摘要

该研究以rbcL基因为标记基因,进行了胶州湾春季、夏季、秋季浮游植物分子遗传多样性,初步探讨了季节间浮游植物的动态变化.分别于春、夏、秋三季提取胶州湾表层海水浮游生物总DNA,用PCR方法扩增浮游植物核酮糖1,5-二磷酸羧化/氧化酶大亚基(rbcL)基因片段,构建三季节rbcL基因片段质粒文库;随机从各文库中选择约50个克隆,测定它们的序列.以氨基酸序列相同为标准,共获得59个分类操作单元(OTUs).其中,春季特有的21个,夏季特有的13个,秋季特有的23个.有两个OTUs为春、夏季表层海水共有.基于OTU丰度计算的香农氏指数能反映遗传多样性水平.胶州湾春、夏、秋三季的香农氏指数分别为2.69、2.44和2.76,表明秋季胶州湾浮游植物遗传多样性最丰富.春、夏、秋三季浮游植物群落组成差异显著.除夏秋季有两个OTUs相同外,其它OTUs在季节间完全不同,表明海水浮游植物群落结构是动态的,随时间、空间不同而变化.另外,我们还设计了甲藻核糖体小亚基基因(ribosomal RNA small subunit gene,ssu rDNA)特异引物,对胶州湾表层海水甲藻遗传多样性进行了初步研究.测序分析证实我们所设计的引物具有甲藻特异性,能够从复杂海水浮游生物混合DNA中特异地扩增出甲藻ssu rDNA序列.研究表明胶州湾表层海水浮游甲藻具有丰富的遗传多样性.

目录

文摘

英文文摘

第一章文献综述

第二章胶州湾浮游植物rbcL基因分子遗传多样性

第一节秋季胶州湾浮游植物rbcL分子遗传多样性研究

第二节春季胶州湾浮游植物rbcL分子遗传多样性研究

第三节夏季胶州湾浮游植物rbcL分子遗传多样性研究

第四节胶州湾浮游植物rbcL分子遗传多样季节比较研究

第五节讨论

第三章 胶州湾甲藻18S rDNA分子遗传多样性

参考文献

致谢

论文发表情况