利用微卫星标记分析山东地方鸡品种的遗传多样性

摘要

该文分别用变性PAGE与非变性PAEG分析鸡微卫星DNA.结果发现：在变性胶上纯合个体为一条带,杂合个体为两条带;而在非变性胶上,纯合个体为两条带,杂合个体为三或四条带,据分析原因可能与电压、温度及双链的构象有关;在判读DNA时,一般读取前面的带,纯合个体读前面一条,杂合个体读前面两条带.再根据里德伍克的分子量计算公式,算出的目的带分子量与测序结果完全相同.因此该文认为在检测微卫星时可以用非变性胶进行电泳,再结合测序与分子量计算公式是完全可行的.选用5个多态性较好的微卫星标记,检测了山东省仅存的5个地方鸡种：日照麻鸡、寿光鸡、莱芜黑鸡、济宁百日鸡、鲁西斗鸡,以及一个外来鸡种--安卡黄鸡（原产地为以色列）和一个外省地方鸡种--广西黄鸡的遗传多样性.共检测到40多个等位基因,其中以ADL136的等位基因数最多（10个）;而ADL146的等位基因数最少（5个）;其他位点等位基因数为8、9个不等.

目录

英文缩略表

1.引言

1.1我国地方鸡种遗传多样性的研究现状

1.2微卫星分子标记的研究现状

1.3本课题研究的目的和意义

2.材料与方法

3.结果与分析

3.1鸡基因组DNA的提取

3.2微卫星引物PCR扩增

3.3聚丙烯酰胺凝胶电泳分析微卫星标记方法的建立

3.4各微卫星位点基因型检测的结果

3.5微卫星目的片段的克隆测序

3.6 7个品种各位点的等位基因频率

3.7品种内的遗传变异检测—群体平均杂合度

3.8品种间的遗传距离

3.9品种间的聚类分析

4讨论

5结论

参考文献

致谢

附图