黄瓜花叶病毒和花生斑驳病毒分子变异分析

摘要

黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus，CMV)是目前世界范围内发生最普遍、分布最广、危害最严重的植物病毒。花生斑驳病毒(Peanut mottlevirus，PeMoV)遍及世界花生各产区，主要侵染豆科植物。 本研究从莱芜、青州、日照及泰安表现黄色花叶症状的普通烟草或矮牵牛上获得5个CMV分离物(LW、QZ、RZ、ND1、ND2)，并测定了这5个CMV分离物5个基因的序列。分析表明，根据2b基因可以把CMV分离物分为两个组，而根据其它基因可以把CMV分离物分为三个组(I、II和Ⅲ组)。其中，根据CP、MP、2a和2b基因划分的I组可以进一步分为两个亚组(IA和IB)，而根据1a因划分的I组可以进一步分为三个亚组(IA、IB和IC)。RZ是一个亚组间重排体，而其它4个分离物均属于IB亚组。2b基因处于正向或多样化选择，其它4个基因处于负向或纯化选择。 用RT-PCR方法从山东青岛、寿光、青州、临朐、安丘、泰安、文登、东营、沂源和蒙阴表现花叶、条纹或斑驳症状的28个花生叶片样品上检测出CMV，克隆并测定了这些分离物RNA33'端序列。对CMV分离物进行序列分析，结果发现可以把CMV分离物分为三个组(I、II和Ⅲ组)，I组可以进一步划分为IA亚组和IB亚组。这28个CMV花生分离物均属于IB亚组，并与GenBank中两个花生分离物单独成簇。CMV花生分离物CP基因处于负向或纯化选择。种群统计分析发现CMV种群在花生上呈爆发扩张趋势。 用RT-PCR方法从2个花生样品中检测到：PeMoV，并克隆了其3'末端序列。这是我国首次用PCR技术检测到PeMoV。但目前为止，只在青岛检测到此病毒。PeMoVCP基因处于负向(或纯化)选择，尚未发现重组的证据。

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论文说明:缩略词表

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第一章前言

一、黄瓜花叶病毒的研究进展

1.黄瓜花叶病毒的生物学特性

2.黄瓜花叶病毒的分子生物学特性

二、花生病毒病

1.花生的经济重要性

2.花生病毒种类

3.四种主要花生病毒概况

三、植物病毒的遗传变异

1.突变

2.重组

3.重排

4.选择压力、瓶颈效应及奠基者效应

四、本研究的目的和意义

第二章黄瓜花叶病毒5个中国分离物的分子变异分析

1.材料与方法

1.1材料

1.2实验方法

2.结果与分析

2.1以5种CMV分离物的RT-PCR结果

2.2重组质粒的电泳鉴定

2.3重组质粒的PCR鉴定

2.4序列测定

2.5黄瓜花叶病毒的分子变异分析

3.结论与讨论

第三章花生上黄瓜花叶病毒和花生斑驳病毒分子变异分析

1.材料与方法

1.1材料

1.2实验方法

2.结果与分析

2.1黄瓜花叶病毒检测结果与分析

2.2花生斑驳病毒检测结果与分析

3.结论与讨论

全文结论

参考文献

致谢

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附录