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海洋细菌中参与二甲基巯基丙酸内盐代谢产物丙烯酰辅酶A和二甲基硫代谢关键酶的结构与催化机制研究

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第一章研究背景与立题依据

1.1研究背景

1.1.1海洋硫循环

1.1.2海洋中的DMSP和DMS

1.1.3 DMSP的代谢

1.1.4丙烯酸的代谢

1.1.5 DMS的代谢

1.1.6 DMS的产生方式

1.2立题依据

1.3研究内容

第二章丙烯酰辅酶A还原酶AcuI的结构与催化机制研究

2.1引言

2.2实验材料

2.2.1菌株与载体

2.2.2药品与试剂盒

2.2.3缓冲液与培养基

2.2.4实验仪器

2.3实验方法

2.3.1表达载体的构建

2.3.2 AcuI蛋白的表达与纯化

2.3.3 AcuI活性检测

2.3.4圆二色谱分析

2.3.5蛋白质结晶与优化

2.3.6数据收集及结构解析

2.4结果与分析

2.4.1 AcuI序列分析

2.4.2 AcuI体外酶活检测

2.4.3 AcuI整体结构

2.4.4 AcuI结构中的关键氨基酸残基

2.4.5 AcuI催化机制分析

2.5讨论

第三章丙烯酰辅酶A水合酶RdAcuH的结构与催化机制研究

3.1引言

3.2实验材料

3.2.1菌株与载体

3.2.2药品与试剂盒

3.2.3缓冲液与培养基

3.2.4实验仪器

3.3实验方法

3.3.1表达载体的构建

3.3.2 RdAcuH蛋白的表达与纯化

3.3.3 RdAcuH活性检测

3.3.4圆二色谱分析

3.3.5动态光散射分析

3.3.6蛋白质结晶与优化

3.3.7数据收集及结构解析

3.4结果与分析

3.4.1 RdAcuH序列分析

3.4.2 RdAcuH体外酶活检测

3.4.3 RdAcuH整体结构

3.4.4 RdAcuH结构中的关键氨基酸残基

3.4.5 RdAcuH催化机制分析

3.5讨论

第四章DMS单加氧酶DmoA的结晶与结构分析

4.1引言

4.2实验材料

4.2.1菌株与载体

4.2.2药品与试剂盒

4.2.3缓冲液与培养基

4.2.4实验仪器

4.3实验方法

4.3.1表达载体的构建

4.3.2 DmoA蛋白的表达与纯化

4.3.3 DmoA活性检测

4.3.4蛋白质结晶与优化

4.3.5数据收集及结构解析

4.4结果与分析

4.4.1 DmoA序列分析

4.4.2 DmoA体外酶活检测

4.4.3 DmoA整体结构

4.4.4 DmoA结构中关键氨基酸残基及底物结合口袋分析

4.5讨论

第五章甲硫醇甲基转移酶MddA的异源表达与酶学性质分析

5.1引言

5.2实验材料

5.2.1菌株与载体

5.2.2药品与试剂盒

5.2.3缓冲液与培养基

5.2.4实验仪器

5.3实验方法

5.3.1表达载体的构建

5.3.2 MddA蛋白的异源表达与纯化

5.3.3 MddA体外酶活检测与性质分析

5.4结果与分析

5.4.1 MddA序列分析

5.4.2 MddA蛋白的异源表达与纯化

5.4.3 MddA体外酶活检测与性质分析

5.5讨论

全文总结及展望

参考文献

攻读博士学位期间发表的论文

致谢

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