中国北方地区HIV-1 B'nef基因多态性及其对疾病进展影响的研究

摘要

HIV- nef 基因是影响疾病进程的重要因素之一，其多态性可能影响HIV-1的感染和AIDS的疾病进程。调节因子Nef是一个具有多种效应功能的蛋白质，对人体内病毒复制和AIDS的发病起到重要作用。国外对B亚型、CRF01_AE和SIV的研究表明nef基因的缺陷或缺失与HIV感染后疾病长期不进展相关。但对印度C亚型感染者的研究却不支持此结论。由于nef存在基因多态性，是否由于不同亚型、不同人群氨基酸序列的突变位点而导致疾病进展不同呢?B'亚型在中国流行最为广泛，中国HIV-1感染人群nef基因多态性对疾病进程的是否产生影响呢?本研究拟通过对我国B'亚型HIV-1感染者病毒基因组中nef的系统进化和氨基酸序列多态性的分析，明确中国感染HIV-1 LTNPs是否存在nef基因的缺陷和变异，及其对HIV-1疾病进展有无影响；评估nef基因的重要功能区的保守程度。为深入了解我国HIV的治病机理提供科学的依据。 方法: 收集我国HIV感染者的流行病学资料、临床资料及全血标本。HIV-1 nef基因序列测定：QIAamp Blood Mini Kit(德国)从全血标本中提取基因组DNA(含有整合的HIV-1前病毒DNA)，提取的DNA以nef基因区特异性引物01、02为外侧引物进行第一轮PCR扩增，以11、12为内侧引物进行nested-PCR扩增。1％琼脂糖凝胶电泳检测目的扩增片断，与分子量Marker对比无误后，用德国Qiagen公司的Gel Extraction Kit试剂盒对PCR产物进行纯化，使用美国Applied Biosystem公司的BigDye Terminator Sequencing试剂盒和.ABI 3130型DNA测序仪测序。不同疾病进展阶段的HIV-1感染者体内HIV-1核苷酸及氨基酸序列特征分析：按不同疾病进展阶段对我国HIV-1感染者进行分组。使用BIOEDIT软件包中CLASTALW程序进行序列排列比对，并在核苷酸序列中人工引人gaps以保持翻译完整性。 结论: 1、中国北方地区HIV-1 B'亚型nef基因无明显缺失或缺陷； 2、中国北方地区HIV-1 B'亚型nef基因的缺失和缺陷与疾病长期不进展无相关性； 3、中国北方地区HIV-1 B'亚型nef基因序列21位K、E、H、I、Q取代R可能与疾病缓慢进展有关； 4、中国北方地区HIV-1 B'亚型nef基因序列15位R、K、N取代S、 39位R、E、N取代K，可能与疾病进展相关； 5、中国北方地区HIV-1 B'亚型nef氨基酸序列的重要功能区较为保守。

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实验结果

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结论

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参考文献

综述HIV-1 nef基因多态性影响HIV-1感染和AIDS疾病进程的研究进展

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