应用微卫星标记分析中国驴品种的遗传多样性

摘要

该研究以关中驴、晋南驴、广灵驴、德州驴和华北驴五个中国驴品种为研究对象,利用9个微卫星标记分析了品种内和品种间的遗传多样性.座位AHT5没有扩增,其余8个座位均表现高度多态.8个微卫星座位的等位基因数为4~12个,平均为8.6个,期望杂合度在0.869~0.644之间,平均为0.753,多态信息含量在0.554~0.745之间,平均为0.668.五个驴品种整体上处于Hardy-Weinberg平衡状态,在8个微卫星座位的平均等位基因数在5.8~6.5个之间,平均期望杂合度在0.690~0.755之间.经方差分析,五个驴品种间等位基因数、期望杂合度和多态信息含量无显著差异.五个驴品种两两之间均显著分化,总体上,在总变异中有5.3％属于品种间的变异.经Friedman检验,群体间分化程度的三种估计量θ(Weir和Cockerham,1984)、G<,ST>(Nei,1973)和ρ<, ST>(Rousset,1996)之间无显著差异.以遗传距离D<,A>(Nei,1983)、D<,AS>(Chakraborty,1993)、D<,R>(Reynolds,1983)、D<,SW>(Shriver,1983)、(δ<,μ>)<'2>(Goldstein,1995)构建NJ、UPGMA一致树,结果表明:由遗传距离D<,A>、D<,AS>构建的NJ、UPGMA一致树及由遗传距离D<,R>、D<、(δ<,μ>)<'2>构建的NJ一致树的拓扑结构完全一样.由D<,SW>、(δ<,μ>)<'2>构建的UPGMA一致树相同,由DR构建的UPGMA一致树和前两类树均不同.D<,SW>、(δ<,μ>)<'2>的一致树的自展置信值和DA、DAS、DR一致树的自展置信值相当.五个驴品种间的遗传关系和前人研究有所不同,有待于基于较多微卫星座位和品种历史的进一步研究.以遗传距离Ds和(δ<,μ>)<'2>,每世代每座位的突变率为10<'-4>,驴的世代间隔为3.5年,估计了五个驴品种间的分化时间.结果表明:以Ds估计的五个品种的分化时间在公元前1724~公元294年间,和历史的记载较吻合.

目录

文摘

英文文摘

1文献综述

2材料和方法

2.1实验材料

2.2实验方法

2.3统计方法

2.3.1群体内遗传多样性的分析

2.3.2群体间的遗传关系

3结果与分析

3.1五个品种8个微卫星座位多态性

3.1.1五个驴品种8个微卫星座位的等位基因频率

3.1.2五个驴品种8个微卫星座位的等位基因数（A）和有效等位基因数（E）

3.1.3五个驴品种8个微卫星座位的Hardy-Weinberg平衡的检验

3.1.4五个驴品种的杂合度和多态信息含量

3.2 五个驴品种间的遗传分化

3.3聚类分析结果

3.3.1五个驴品种系统发生树的拓扑结构

3.3.2五个驴品种间的分化时间

4讨论

4.1关于PCR和凝胶电泳

4.2关于群体间遗传分化

4.3关于五个驴品种的聚类分析

4.4关于品种间遗传多样性差异的显著性检验

5结论

参考文献

致谢

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