碧湖猪若干特征基因多态性及种质特性研究

摘要

猪种资源的不断减少已严重阻碍了我国乃至世界猪育种事业发展，影响养猪产业的持续健康发展，因此，加强猪种资源保护与利用的形势已十分紧迫。碧湖猪是我国优良的地方猪品种，但迄今为止对碧湖猪的研究报道仍很少。一直以来，猪的抗病育种都是猪育种工作者的目标，标记辅助选择已成为现代猪育种工作的手段，抗原处理相关转运体1（Transporter associated antigen processing，TAP1）、杀菌通透性增加蛋白(bactericidal/permeability-increasing protein，BPI)、抗黏液病毒基因1(myxo-virus resistance，Mx1)、α(1，2)岩藻糖转移1(alpha(1，2)fucosyltransferase1)(FUT1)及粘液素基因4(MUC4)与许多疾病有着密切联系，都是重要的猪抗病候选基因。本研究探讨了上述特征基因的多态性及与碧湖猪生产性能的关联性，并对碧湖猪的头型特征、胴体品质、生产性能、生长发育规律、繁殖性能等种质特征进行研究分析，以期为进一步筛选与碧湖猪抗病性相关的分子标记奠定基础，同时根据猪场主要流行疫情修订相应免疫程序，为碧湖猪的保种选育和开发利用提供科学参考。本研究主要试验结果如下:
　　根据碧湖猪嘴型分成长嘴和短嘴两组，并对两种嘴型碧湖猪的头型特征、胴体性状、肉质性状及生产性能等进行比较。结果表明:长嘴和短嘴碧湖猪不仅在头型特征上有明显区别，而且在胴体性状、肉质性状及生产性能等方面也存在差异，认为碧湖猪可按头型分成两个品系。
　　对碧湖猪体重、体尺及6月龄膘厚进行测定，并与1993年、1981年的测定数据比较。结果表明:2011年测定的数据除初生重明显高于1981年的数据外，其它各项测定指标均未超过1981年和1993年的数据。经多年提纯选育的碧湖猪的早期生长发育性状没有明显改变，提示其早期生长发育性状遗传较为稳定。
　　碧湖猪的肥育性能及胴体品质情况为:2011年（七世代）测定的胴体长显著高于1993年（四世代）的数据，而膘厚（6～7肋）和眼肌面积显著低于1993年，其他测定项目差异均不显著;日增重比和料肉比均比1993年逊色。可见对碧湖猪的连续选育，由于注意体型、外貌的选择，其个体体尺性状表型值虽有提高，但生长速度与饲料利用率却有降低现象。
　　对碧湖猪的4个体重性状和9个体尺性状进行了典型相关分析。结果表明，体重性状与体尺性状的第一、第二典型相关系数达到了显著水平，分别为0.9980和0.9933，占总相关信息的98.95％;说明体重性状与体尺性状存在相关关系，而且这两组性状的显著相关主要是由20d体重、6月龄体重与6月龄的后躯高、胸围、腹围、腿臀围的密切相关引起的。
　　对一世代到六世代碧湖猪繁殖性状的记录数据进行整理和分析，发现一世代的产活仔数显著低于三世代和六世代碧湖猪，成活率显著低于五世代和六世代碧湖猪，20d窝重显著低于三世代碧湖猪，断奶个重和断奶窝重显著低于三世代和五世代碧湖猪，产仔数以三世代最高，六世代的初生个重显著高于三世代和五世代碧湖猪，且这4个世代的育成率差异不显著。结果提示，随着选育工作的进行，碧湖猪的繁殖性能有较大提高，说明1988年至2009年间的连续世代选育对繁殖性能有一定效果。
　　利用通径分析和多元逐步回归分析等方法对232窝浙江省丽水市畜牧良种场1988-2009年碧湖母猪产仔哺育记录的原始档案数据进行分析，找到了影响碧湖猪断奶窝重的主要繁殖性状是断奶个重。影响断奶窝重的最优回归方程为:Y=-57.2442+0.60612X2-13.3942X3+0.7026X4+7.7633X5。
　　利用PCR-RFLP方法对111个碧湖猪个体TAP1基因外显子2的基因型进行检测，TAP1基因经MboⅠ酶切消化后，产生44个AA型个体、41个AB型个体、26个BB型个体。基因型频率分别为AA0.396、AB0.369、BB0.234，敏感等位基因A为优势等位基因，其频率为0.581。3种基因型个体早期生长发育性状的比较分析结果显示，AA型个体的背膘C显著高于BB型个体，腿臀围显著低于BB型个体;而AB型个体与两种纯合体的差异均不显著。其余测定项目，包括初生重、20d重、60d重、6月龄重、体长、体高、后躯高、胸围、腹围、后管围、前胸宽、腿臀宽、头长、头宽、头深、背膘A、背膘B等生长发育性状在各基因型间的差异均未达显著水平。11头碧湖猪（6个AA型个体、4个AB型个体、1个BB型个体）胴体性状的比较分析结果表明，宰前活重、屠宰率、左半胴体重、胴体体长、前背膘厚、6-7肋背膘厚、背膘厚（中）、背膘厚（后）、眼肌面积、肌内脂肪含量（脂肪、蛋白质、水）等12个测定项目在3种基因型间的差异均不显著。
　　对111头碧湖猪个体BPI基因第10外显子的基因型进行检测，将BPI基因经HpaⅡ酶切消化后，产生6个AA型个体、57个AB型个体、48个BB型个体。基因型频率分别为AA0.054、AB0.514、BB0.432，敏感等位基因B为优势等位基因，其频率为0.730。而且X2适合性检验结果显示，碧湖猪BPI基因第10外显子HpaⅡ基因酶切位点已经达到Hardy-Weinberg平衡状态。3种基因型个体的早期生长发育性状及胴体性状的比较分析结果显示，它们之间的差异均不显著。结果提示，对具有特征性能的TAP1和BPI基因的选择利用不会造成猪生产性能的下降，利用其作为抗病育种的分子标记具有一定的可行性。
　　对111个碧湖猪个体Mx1基因第14外显子的基因型进行检测，结果均为AA型;对21头碧湖猪个体FUT1基因M307位点基因型进行检测，结果均为BB型;对21头碧湖猪个体MUC4基因型进行检测，结果均为AA型。上述3个基因均呈极端偏态分布。
　　统计分析近一年来碧湖猪保种场发病并死亡情况，结果发现，猪场病死的主要为初生仔猪及断奶仔猪，流行的疫病主要是仔猪水肿病，传染性胃肠炎，猪肺疫，仔猪大肠杆菌病和蓝耳病。实验参考猪场实际情况，针对主要流行的疫病，修订原免疫程序，为碧湖猪更好的繁殖与选育工作提供有力保障。