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摘要
本文所用主要缩略词
第一章 分子标记定位研究进展
1.1 分子标记种类
1.1.1 RFLP(Restriction fragment length polymorphisms)标记
1.1.2 RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)标记
1.1.3 SSR(Simple sequence repeats)标记
1.1.4 AFLP(Amplified Fragment Length Polymorphism)标记
1.1.5 SRAP(Sequence-related amplified polymorphism)标记
1.1.6 SNP(Single nucleotide polymorphism)标记
1.1.7 RGAP(Resistance gene analog polymorphism)标记
1.1.8 REMAP(Retrotransposon Microsatellite Amplified polymorphism)标记
1.1.9 CAPS(Cleaved Amplified Polymorphic Sequence)标记
1.1.10 STS(Sequence Tagged Site)标记
1.1.11 TRAP(Target Region Amplified Polymorphism)标记
1.2 作图群体的类型
1.3 QTL的定位方法
1.3.1 单标记分析法
1.3.2 区间作图法(Interval mapping,IM)
1.3.3 复合区间作图法(Composite Interval Mapping,CIM)
1.3.4 多重区间作图法(Multiple Interval Mapping,MIM)
1.3.5 基于混合线性模型的复合区间作图法(Mixed Composite Interval Mapping,MCIM)
1.4 棉花分子遗传图谱的构建
1.4.1 偏分离位点产生的原理及分布特征
1.5 抗病性状的基因定位
1.6 纤维品质性状的基因定位
1.7 产量性状的基因定位
第二章 棉花纤维强度发育基因的研究进展
2.1 棉纤维细胞发育的过程
2.2 次生壁合成期
2.3 棉纤维次生壁合成相关基因的研究进展
第三章 棉花黄萎病抗性基因研究进展
3.1 毒素和引发体
3.2 植物对黄萎菌侵染的防卫反应的互作模式
3.3 宿主对黄萎病防卫反应的信号传导
本研究的目的和意义
第四章 陆地棉的产量、纤维品质以及抗黄萎病性状的QTL定位研究
4.1 材料和方法
4.1.1 材料
4.1.2 方法
4.2 结果与分析
4.2.1 亲本及重组自交系群体性状的表现
4.2.2 重组自交系群体性状的相关分析
4.2.3 遗传图谱的构建
4.2.4 性状的QTL定位
4.2.5 QTL与环境互作的检测(EE-QTL)
4.3 讨论
4.3.1 偏分离的遗传本质
4.3.2 棉花黄萎病抗性的遗传复杂性
4.3.3 Prema纤维品质优异表现的遗传基础
4.3.4 陆地棉的遗传狭窄
4.3.5 亲本间差异不显著性状的QTL定位
4.3.6 陆地棉衣分的遗传
4.3.7 不同环境下检测到的相同的QTL及其在育种上的应用潜力
第五章 棉花纤维强度QTL候选基因的克隆与分析
5.1 材料和方法
5.1.1 材料
5.1.2 方法
5.3 结果与分析
5.3.1 陆地棉纤维强度候选基因的基因组序列的基因预测与解释
5.3.2 陆地棉总RNA的质量分析
5.3.3 陆地棉纤维强度候选基因的PCR鉴定和测序鉴定
5.3.4 重组菌落的PCR鉴定
5.3.5 候选基因基因组序列的测定与生物信息学分析
5.3.5 GhUBX基因在不同纤维发育时期的表达分析
5.4 讨论
第六章 爱字棉黄萎病抗性QTL候选基因的研究
6.1 材料
6.1.1 菌株和载体
6.1.2 培养基
6.1.3 酶和试剂
6.1.4 试剂盒
6.1.4 候选基因的克隆和定量分析的引物
6.2 方法
6.2.1 目标区域候选基因的预测
6.2.2 引物的PCR扩增与条带的回收和测序
6.2.3 网络生物信息学分析资源及软件
6.2.4 棉花接种菌后不同时期的总RNA提取与候选基因的表达分析
6.3 结果与分析
6.3.1 陆地棉黄萎病抗性相关的候选基因的基因组序列的基因预测
6.3.3 陆地棉黄萎病抗性QTL区域的候选基因的PCR扩增
6.3.4 重组菌落的PCR鉴定
6.3.5 候选基因基因组序列的测定与生物信息学分析
6.3.6 棉花黄萎病抗性候选基因在亲本接菌后不同时期的表达分析
6.4 讨论
全文结论
研究创新点
附录
参考文献
致谢