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含硝基的赝二肽类化合物作为基质金属蛋白酶-7选择性抑制剂的研究

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摘要

第一章 绪论

1.1 基质金属蛋白酶-7

1.2 基质金属蛋白酶抑制剂(MMPI)

1.3 基质金属蛋白酶-7选择性抑制剂

1.4 本文研究的主要内容

第二章 P2'侧链对脚-7抑制效能的影响

2.1 合成

2.2 动力学

2.3 计算结果

2.4 构效关系

第三章 高选择性MMP-7抑制剂

3.1 设计思想

3.2 合成

3.3 动力学

3.4 计算结果

3.5 构效关系

第四章 实验部分

4.1 原料和仪器

4.2 合成

4.3 动力学测试

4.4 分子对接

第五章 结论

参考文献

致谢

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摘要

基质金属蛋白酶-7(matrix metalloproteinases-7,MMP-7)是结构域最小的金属基质蛋白酶。它由肿瘤细胞分泌,并且能够诱导肿瘤细胞向癌细胞演变。在肺癌、肝癌、胸腺癌、胰腺癌等多种恶性肿瘤中均发现了MMP-7的过度表达或过度活化。因此,开发有效的MMP-7选择性抑制剂对于癌症的治疗有着广阔的药物前景。
  由于MMP-1和MMP-7具有相似的S1'疏水性口袋,探索相对于MMP-1的MMP-7选择性抑制剂到目前为止仍然是一项挑战。本文研究了侧链优化策略在开发MMP-7选择性抑制剂的可行性和阶段性成果。
  本文首先设计并合成了(2R)-2-异丁基-3-硝基丙酰-(S)-苯丙氨酰-3-三氟甲基苄胺、(2R)-2-异丁基-3-硝基丙酰-(S)-酪氨酰-3-三氟甲基苄胺、(2R)-2-异丁基-3-硝基丙酰-(S)-天冬氨酰-3-三氟甲基苄胺三个目标化合物,探讨P2'侧链对MMP-7抑制效能及选择性的影响。具体的动力学测试结果:对MMP-7的抑制常数分别为4.1μM,4.4μM,1.6μM,选择性分别为4.9,9.3,10.6。这说明P2'侧链的优化提高了对三种MMP的抑制活性,但其选择性上存在缺失。分子对接结果表明硝基与催化锌离子的双齿方式,以及抑制剂骨架与MMP催化活性域的残基形成的氢键数目,决定了抑制剂的抑制活性。
  本文在此构效关系的基础上,进一步合理设计,引入3,4-二甲氧基-(R)-多巴甲酯作为P3'侧链,合成了(2R)-2-异丁基-3-硝基丙酰-(S)-叔亮氨酰-3,4-二甲氧基-(R)-多巴甲酯。动力学结果表明,该化合物是目前为止对MMP-7选择性最好的化合物,其抑制常数Ki值为0.45μM,达到了亚微摩级别,并且其选择性MMP-7/MMP-1约为50。其P3'侧链上的两个甲氧基和一个酯基能与S3'口袋上的残基形成更为丰富的氢键,对抑制剂抑制效能有一定的影响。

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