利用SSR分子标记研究鹅掌楸天然群体遗传结构

摘要

鹅掌楸为我国珍惜濒危树种，开展鹅掌楸天然群体遗传结构研究对于该物种的保护及开发利用有重要意义。本研究以鹅掌楸11个天然群体为材料，利用SSR分子标记对其遗传结构、遗传多样性动态变化趋势进行了研究。主要研究结果如下： 在物种水平上，14对SSR引物共检测到83个等位基因，平均观察等位基因数(A)为5.93，平均有效等位基因数(Ne)3.3，Shannon多样性指数平均为1.2988，平均期望杂合度(He)为0.5097，Nei遗传多样性指数(h)为0.6493。表明鹅掌楸天然群体中存在较高的遗传多样性。在群体水平上，各群体内的有效等位基因数介于2.04-2.77之间，各居群内观察杂合度(Ho)值变动范围为0.398-0.615，期望杂合度(He)值变动范围为0.425-0.630，说明各居群间的多态性水平差异较大。 基因分化系数(Fst)0.1931，即有19.31％的遗传变异存在11个群体之间，绝大部分变异(80.69％)存在于群体内。基因流(Nm)为1.0444,表明群体间存在一定水平的基因流，且西部群体基因流明显大于东部。 通过Nei's遗传距离的UPGMA聚类分析，11个群体大体可分为4个大类：四川叙永，贵州习水，云南文山，云南金平4个群体为一类；贵州黎平，贵州松桃，浙江安吉，安徽绩溪4个群体为一类;湖北咸宁群体为一类；浙江遂昌与福建武夷山2个群体为一类。 以黎平天然林群体及其子代群体为材料，研究了鹅掌楸群体遗传多样性的变化趋势。鹅掌楸子代群体遗传多样性略大于亲本天然群体，表明自然状况下，鹅掌楸具有遗传多样性自我保持的机制。 最后，根据本实验结果结合鹅掌楸濒危现状，本文还对鹅掌楸种质资源保存利用策略进行了探讨。

目录

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致谢

第一章文献综述

1.1群体遗传结构研究进展

1.1.1群体遗传结构的概念与意义

1.1.2群体遗传结构的研究方法

1.1.3群体遗传结构的度量方法

1.1.4群体遗传结构研究常用的分子标记类型及特点

1.1.5 SSR标记在林木群体遗传结构研究中的应用

1.2鹅掌楸属树种研究进展

1.2.1生殖生物学研究

1.2.2鹅掌楸的地理变异

1.2.3遗传多样性研究

1.2.4交配系统研究

1.2.5材性研究

1.2.6杂交育种及无性繁殖研究

1.3本研究的目的意义

第二章鹅掌楸天然群体遗传结构

2.1实验材料

2.1.1试验取样群体

2.1.2样本采集及处理

2.2实验方法

2.2.1总DNA的提取与纯化

2.2.2 DNA质量的检测

2.2.3引物的获得

2.2.4 SSR-PCR扩增反应

2.3结果与分析

2.3.1不同位点的多样性分析

2.3.2群体遗传多样性

2.3.3群体遗传分化与基因流分析

2.3.4 Hardy-Weinberg平衡检测与连锁不平衡分析

2.3.5群体间遗传距离

2.4 讨论

2.4.1试验方法

2.4.2 SSR引物及数据分析

2.4.3 SSR遗传多样性比较

2.4.4鹅掌楸天然群体遗传结构

2.4.5遗传距离与地理距离相关性分析

第三章鹅掌楸天然群体与子代群体遗传多样性比较

3.1试验材料与方法

3.1.1试验材料

3.1.2试验方法

3.2结果与分析

3.2.1鹅掌楸亲、子群体SSR位点的遗传多样性

3.2.2鹅掌楸天然群体遗传多样性

3.3 讨论

第四章鹅掌楸天然群体现状与保护策略

4.1天然群体现状与天然更新状况

4.2.保护策略

4.2.1鹅掌楸致濒的机理

4.2.2鹅掌楸保护策略与方式探讨

第五章结论及进一步研究展望

5.1主要结论

5.2进一步研究方向

参考文献