实验红鲫C1HD系基因纯合度的AFLP和SSR分析

摘要

目的：通过对实验红鲫C1HD系和普通红鲫基因组DNA进行的扩增片段长度多态性(AFLP)分析和微卫星多态性(SSR)分析，研究实验红鲫C1HD系的基因纯合度信息，进一步完善实验红鲫C1HD系的遗传背景资料。 方法：使用从20对选择性引物随机组合中筛选的10对AFLP选择性引物和9对微卫星引物，分别对8尾实验红鲫C1HD系和8尾普通红鲫红细胞核基因组DNA进行PCR扩增。对PCR产物分别进行电泳分离，硝酸银染色后，对其电泳图谱进行遗传多样性分析。 结果：AFLP分析结果显示两群体内的DNA多态性存在差异。在实验红鲫C1HD系共扩增69多态性条带；普通红鲫扩增的多态性条带数为91。实验红鲫C1HD系和普通红鲫多态性位点比例分别为22.08％和38.90％；遗传相似度分别为0.930和0.825。两个群体进行微卫星分析，得出实验红鲫C1HD系和普通红鲫遗传相似度分别为0.932和0.867。经UPGMA法构建的聚类系统树显示实验红鲫C1HD系的8个个体和普通红鲫的8个个体分别聚成不同的分支，且普通红鲫个体间分支距离远大于实验红鲫C1HD系个体间的分支距离。 结论：在AFLP和SSRs标记方面，其基因纯合度达93％以上，符合近交系实验动物基因纯合度要求。