RV野毒株L基因C端3'-RACE扩增及序列分析

摘要

本研究为了丰富我国狂犬病分子流行病学研究资料，对我国分离自不同动物的两个野毒株进行基因组部分序列的测定和分析。 本实验以吉林鹿源DRV8202株及河南鼠源野毒株MRV的L基因的C端为主要研究内容，用RT-PCR和3’-RACE方法对其进行了克隆和测序，将所测得的核苷酸序列和推导的氨基酸序列分成两个部分，一是L基因C端序列，另一个是L基因5’端的非编码区(NCS)，并与NCBI上公开发表的狂犬病毒其它毒株的相应片段进行分析比较。 结果表明DRV8202与MRV该段核苷酸序列及氨基酸序列同源性为91.3﹪和95.8﹪，两者均属于基因Ⅰ型。为了进一步分析两株狂犬病病毒基因及其产物的特点，在扩增片段序列末端从终止密码开始L基因5’端的非编码区序列，长54nt，将其与RV其他毒株相应序列进行比较。结果显示MRV与DRV8202株L基因5’末端核酸序列的同源性最低为64.8﹪。通过对NCS各种碱基的统计分析发现，所比较的这几株狂犬病毒末端G+C含量均高于38.89﹪，其中DRV8202株G+C含量为51.85﹪；MRV株为42.95﹪，而两株各种碱基组成含量相差较远。LP其氨基酸组成中以碱性氨基酸居多，蛋白质中的两个区域(第851～869和第1962～1980位)为疏水区，这两个区域可能参与与L蛋白同N和M1蛋白的相互作用，通过比对发现，在851～869区域DRV8202株病毒在856位上的Met突变为Val；在1962～1980区域MRV株在1971位的Ala突变为Ser，其他氨基酸均没有发生变异。

目录

文摘

英文文摘

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第一部分 文献综述

第二部分 正文

第三部分结论

参考文献

附录1DRV8202株、MRY株的F、K、H片段的测序结果

附录2狂犬病毒DRV8202、MRV与其它毒株L基因C端氨基酸序列多重比较

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