声明
第一章 文献综述
1.1 水稻属进化与起源
1.2 水稻属不同种基因组组装研究进展
1.3 长雄蕊野生稻研究进展
1.4 水稻PPR基因家族分析研究
1.5 水稻抗病基因家族研究进展
1.6 本研究的目的与意义
第二章 材料方法
2.1 实验材料
2.2 实验方法
2.3 数据分析
第三章 长雄蕊野生稻基因组组装
3.1基因组组装策略与结果
3.2 参考日本晴基因组锚定Scaffolds
3.3 基因组组装质量评估
3.4 基因注释
3.5 TE注释
3.6 Non-coding RNA注释
3.7 讨论
第四章AA型水稻近缘种基因组比较分析
4.1 系统发生树
4.2 基因家族收缩与扩张
4.3 R基因家族鉴定与动态进化
4.4 PPR基因家族鉴定与动态进化
4.5 基因组共线性与结构变异
4.6 讨论
第五章 非洲水稻起源与进化
5.1非洲本土三个水稻种的群体进化关系
5.2 讨论
第六章 总讨论
参考文献
博士在读期间发表的论文
