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第一章文献综述
1.1有机磷酸酯类化合物
1.1.1有机磷类杀虫剂
1.1.2有机磷类神经毒剂
1.2有机磷农药的毒理效应
1.3有机磷农药的环境归趋与污染修复
1.3.1环境归趋
1.3.2污染修复
1.3.3生物降解
1.4有机磷降解酶
1.4.1 OPH/opd酶类
1.4.2 ADPase/adpB酶类
1.4.3 B-5/opd水解酶类
1.4.4 OPDA/opdA酶类
1.4.5 HocA/hocA酶类
1.4.6 MPD/mpd酶类
1.4.7 OPAA/opaA酶类
1.5硝基酚类化合物的微生物降解
1.5.1硝基酚类化合物的微生物降解
1.5.2硝基酚类化合物的降解途径
1.5.3硝基酚类化合物降解酶
1.5.4硝基酚类化合物的共代谢
1.6生物信息学在环境微生物降解代谢研究中的应用
1.6.1微生物基因组学
1.6.2基因芯片在环境微生物研究中的应用
1.6.3生物信息学在有机污染物微生物降解研究中的应用
1.7立项依据及研究目的
1.7.1立项依据
1.7.2研究目的
第二章高效降解菌的分离及其生物学特性研究
2.1引言
2.2实验材料
2.2.1 采样
2.2.2菌株和质粒
2.2.3化学药品和抗生素
2.2.4工具酶和生化试剂
2.2.5常用缓冲液
2.2.6常用培养基
2.2.7主要仪器和设备
2.3实验方法
2.3.1降解菌的富集筛选
2.3.2菌体生长量及底物测定
2.3.3细菌鉴定
2.3.4菌株广谱降解特性
2.4结果与分析
2.4.1降解菌的筛选
2.4.2降解菌的形态及生理生化鉴定
2.4.3降解菌的16S rDNA分子鉴定
2.4.4动态降解
2.4.5降解特性研究
2.4.6有机磷农药广谱降解特性
2.4.7芳香族化合物的广谱降解特性
2.5讨论
第三章 有机磷水解酶OPD的基因克隆表达及其结构分析
3.1引 言
3.2实验材料
3.2.1菌株和质粒
3.2.2凝胶及主要缓冲液
3.2.3其它
3.3实验方法
3.3.1细菌基因组DNA的提取
3.3.2细菌质粒的提取
3.3.3 DNA限制性内切酶消化
3.3.4 DNA片段的回收
3.3.5甲基对硫磷水解酶基因opd的克隆
3.3.6原核细胞中重组质粒的筛选
3.3.7重组OPD酶原核表达及SDS-PAGE分析
3.3.8重组甲基对硫磷水解酶OPD的初步研究
3.3.9 OPD酶同源性分析及二级结构预测
3.3.10同源模建分析
3.4结果与分析
3.4.1甲基对硫磷水解酶基因opd的克隆
3.4.2重组质粒pMD-opd的构建及鉴定
3.4.3重组表达质粒pET-opd的构建及鉴定
3.4.4 opd基因在大肠杆菌E.coli BL21中的表达与鉴定
3.4.5酶活性分析
3.4.6有机磷水解酶的生物信息学分析
3.4.7 OPD的二级结构预测
3.4.8 OPD的高级结构同源模建分析
3.5讨论
第四章 降解菌的代谢途径及其应用研究
4.1引言
4.2实验材料
4.2.1受试菌株
4.2.2农药及化学试剂
4.2.3培养基
4.2.4缓冲液
4.2.5仪器设备
4.3分析方法
4.3.1常规分析测定方法
4.3.2代谢物薄层色谱分析
4.3.3 GC分析
4.3.4 LC-ESI/MS分析
4.3.5 COD的测定
4.4结果与分析
4.4.1代谢产物的TLC分析
4.4.2代谢产物的光谱学分析
4.4.3气相色谱(GC)分析
4.4.4液相色谱-质谱(LC-ESI/MS)分析
4.4.5 MP的降解代谢途径
4.4.6 HS-D38降解PNP的动力学分析
4.4.7 HS-D36降解MP的动力学分析
4.4.8降解菌对模拟农药废水的应用研究
4.5讨论
第五章结论
5.1论文小结
5.2本论文的创新点
5.3不足与展望
参考文献
博士期间发表的论文
博士期间参加的国际国内学术会议及论文
致 谢