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论文说明:缩略词表
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1.文献综述
1.1 组蛋白乙酰化的表观遗传基础
1.1.1 染色质的基本结构单位——核小体
1.1.2 异染色质与染色质沉默
1.1.3 染色质重建是基因表达调控过程中的重要环节
1.1.4 染色质调节因子
1.1.5 组蛋白修饰及其在基因调节中的作用和机制
1.1.6 组蛋白乙酰化模式在发育过程中的传递
1.2 组蛋白乙酰化在基因转录调控中的作用
1.2.1 组蛋白乙酰化位点
1.2.2 组蛋白乙酰化对染色质结构的作用机制
1.2.3 组蛋白乙酰化酶(Histone Acetyltransferase/HAT)
1.2.4 组蛋白去乙酰化酶(Histone Deacetylase/HDAC)
1.2.5 组蛋白去乙酰化酶基因在植物基因调控和发育中的作用
1.3 与本研究有关的DNA甲基化研究进展
1.3.1 植物DNA甲基化特征
1.3.2 植物DNA甲基转移酶
1.3.3 植物DNA甲基化的生物学功能
1.3.4 DNA甲基化与植物转座因子活动
1.4 与本研究有关的细胞程序性死亡的研究现状
1.4.1 细胞程序性死亡的概述
1.4.2 植物PCD的特征
1.4.3 植物PCD的相关基因及其调控信号
1.4.4 植物超敏反应与PCD
1.5 植物染色质因子及细胞程序性死亡的研究方法
1.5.1 功能获得与缺失
1.5.2 染色质免疫沉淀
1.5.3 DNA甲基化
1.5.4 基因芯片
1.5.5 TUNEL assay
1.6 本研究的目的和意义
2材料与方法
2.1 水稻材料
2.2 水稻组蛋白去乙酰化酶基因的整理和归类
2.3 序列分析
2.4 水稻组蛋白去乙酰化酶(HDAC)基因的获取
2.5 载体的构建
2.5.1 转化载体
2.5.2 亚细胞定位载体
2.6 遗传转化
2.7 总DNA抽提与Southern杂交
2.8 RNA抽提、RT-PCR和Northern杂交
2.9 水稻全基因组芯片分析
2.10活性氧(ROS)积累的检测
2.1 1原位TUN-EL分析
2.12 GFP观察
2.13组蛋白抽提和Western印迹
2.14染色质免疫沉淀和定量PCR分析
2.15氧化胁迫处理
2.16 DNA胞嘧啶甲基化分析
3 结果与分析
3.1 水稻基因组中组蛋白去乙酰化酶基因的分离克隆与转基因材料的获得
3.1.1 组蛋白去乙酰化酶基因全长编码序列的获得与序列分析
3.1.2 遗传转化材料的获得
3.2 转基因材料分析与HDAC功能研究
3.2.1 组蛋白去乙酰化酶基因OsSRT1对程序性细胞死亡的调控作用
3.2.2 OsHDT702表达受到抑制后对水稻叶片形态的影响
3.2.3 OsHDA710表达受到抑制后对水稻植株高度的影响
4 讨论
4.1 OsSRT1可能具有更加广泛的功能
4.2 OsSRT1在细胞程序性死亡途径的调控作用
4.3 OsSRT1在保持基因组的稳定性上的重要性
参考文献
附录
致谢