声明
摘要
缩略语表
1前言
1.1结核病及治疗策略
1.1.1结核病治疗策略
1.1.2联合用药的重要性
1.2抗结核药物杀菌及分枝杆菌耐药机制
1.2.1抗结核药物杀菌机制
1.2.2结核分枝杆菌耐药菌株的产生
1.2.3结核分枝杆菌耐药机制
1.3基因表达调控与分枝杆菌耐药性的关系
1.3.1基因表达调控及其分类
1.3.2基因表达调控对分枝杆菌耐药性产生的贡献
1.4 TetR/AcrR家族转录因子
1.4.1 TetR/AcrR家族转录因子结构
1.4.2 TetR/AcrR家族转录因子调控机制
1.4.3 TetR/AcrR家族转录因子生理功能
1.5转录因子作为新型药物靶标的前景
1.6本研究目的、意义和思路
2材料与方法
2.1材料
2.1.1供试菌株
2.1.2供试质粒
2.1.3抗生素
2.1.4酶和试剂盒
2.1.5培养基
2.1.6缓冲液及试剂配制
2.2实验方法
2.2.1 EtbR和InhA相关基因的引物设计和PCR扩增反应
2.2.2蛋白质表达纯化
2.2.3染色质免疫共沉淀(ChIP)
2.2.4凝胶迁移阻滞实验(EMSA)
2.2.5 DNA足迹实验(DNase I Footprinting)
2.2.6表面等离子共振(SPR)
2.2.7等温滴定量热实验(ITC)
2.2.8RNA抽提及实时定量PCR(qRT-PCR)
2.2.9 β-半乳糖甘酶活性分析
2.2.10分枝杆菌的基因敲除实验
2.2.11最小抑菌浓度测定(MIC)
2.2.12分枝杆菌生长曲线的测定
2.2.13药物胁迫下胞内结核分枝杆菌生存率分析
3结果与分析
3.1非致死浓度的乙胺丁醇增加分枝杆菌的异烟肼敏感性
3.1.1 EtbR影响分枝杆菌的异烟肼敏感性
3.1.2 EtbR是一个TetR/AcrR家族转录因子
3.1.3 EtbR在分枝杆菌中高度保守
3.2 EtbR识别其自身及inhA基因上游一个20 bp的保守结合位点
3.2.1 EtbR蛋白质的纯化
3.2.2 EtbR在体外特异性结合自身启动子和inhA基因上游的调控序列
3.2.3 EtbR在细菌细胞内结合自身启动子和inhA基因上游的调控序列
3.2.4 EMSA截短实验鉴定EtbR的结合区域
3.2.5 DNA足迹法鉴定EtbR识别一个20 bp的保守结合位点
3.3 EtbR是一个转录抑制子,负调控inhA基因的表达
3.3.1 EtbR超表达菌株和敲除菌株的构建
3.3.2实时定量PCR检测EtbR负调控inhA基因的表达
3.3.3 β-半乳糖甘酶活性实验检测EtbR负调控inhA基因的表达
3.4 EtbR能特异性结合乙胺丁醇
3.4.1 ITC(等温量热滴定法)证实EtbR与乙胺丁醇存在相互作用
3.4.2 SPR(表面等离子共振)证实EtbR与乙胺丁醇存在相互作用
3.5 EMB能促进EtbR的DNA结合活性
3.5.1 EMSA实验证明EMB促进EtbR的DNA结合活性
3.5.2 SPR实验证明EMB促进EtbR的DNA结合活性
3.5.3定量分析EMB促进EtbR的DNA结合活性
3.6.1 β-半乳糖甘酶活性实验验证EMB促进EtbR的转录抑制活性
3.6.2 qRT-PCR检测EMB胁迫下BCG中inhA基因的表达水平
3.7 EtbR增强分枝杆菌中乙胺丁醇介导的异烟肼敏感性
3.7.2 EtbRMtb增强BCG中乙胺丁醇介导的异烟肼敏感性
3.7.3 EtbRMsm增强耻垢分枝杆菌对异烟肼的敏感性
3.7.4 EtbRMsm增强耻垢分枝杆菌中乙胺丁醇介导的异烟肼敏感性
3.8超表达EtbR使药物胁迫下分枝杆菌在小鼠巨噬细胞中的存活率降低
4总结与讨论
4.1总结
4.2讨论
4.2.1 EtbR介导的乙胺丁醇和异烟肼联合使用机制
4.2.2 EtbR是一个新型的转录抑制子,结合EMB负调控inhA基因的表达
4.3展望
参考文献
论文发表情况
致谢