文摘
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1绪论
1.1生物信息学简介
1.2生物信息学的研究现状及任务
1.3论文研究的主要内容
1.4论文研究的主要创新点
1.5论文的结构
2生物序列相似性比对
2.1 DNA序列相似性比对简介
2.2两两序列比对
2.3多序列比对
2.4序列比对算法简介
3基于快速沃尔什变换的分子子序列识别
3.1快速沃尔什变换的简介
3.2基于快速沃尔什变换的DNA分子子序列识别
4基于快速沃尔什变换的两两序列相似性比对
4.1基于快速沃尔什变换的两两序列相似性比对
4.2算法模拟与实现
4.3小结
5基因组DNA序列拼接
5.1大规模全基因组测序技术简介
5.2片断拼接问题及现有技术
5.3两种片断拼接算法
6DNA序列拼接中重复序列屏蔽的一种新方法
6.1含相同重复子序列片段间的关系分析
6.2DNA序列拼接中重复子序列屏蔽方法
6.3结语
结束语
致 谢
参考文献
附录:攻读硕士学位期间发表论文目录