G蛋白偶联受体的同源模建及与分子对接

摘要

G蛋白偶联受体（Guanosine binding Protein Coupled Receptors，GPCRs）作为最大的受体超家族，控制不同的信号转导通路并主导各种主要生物效应，对其进行研究有重要的意义。鱼尼汀受体（Ryanodine Receptor，RyR）作为G蛋白偶联受体家族中的一员，广泛的分布于鳞翅目昆虫体内，是重要的杀虫剂靶标。由于哺乳动物体内也存在鱼尼汀受体，且鱼尼汀受体杀虫剂对哺乳动物的安全性机理尚不清楚。为研究鱼尼汀受体杀虫剂的选择性机理，并为设计出选择性更好、安全性更高的鱼尼汀受体杀虫剂提供理论依据。本论文运用同源模建的方法，以人2型鱼尼汀受体作为模板构建出烟蚜夜蛾鱼尼汀受体。将33种双酰胺化合物分别与模建的烟蚜夜蛾鱼尼汀受体和人2型鱼尼汀受体进行分子对接研究，通过对接打分函数结果进行分析，并对其相互作用机理的差异性进行了讨论。
　　主要研究内容如下：
　　1.运用同源模建的方法，将人2型鱼尼汀受体（HumanRyanodine Receptor2）作为模板，构建烟蚜夜蛾鱼尼汀受体（Heliothis Virescens Ryanodine Receptor），并进行分子动力学实验。然后通过 Ramachandran图对所建模型进行分析，验证模型的可靠性与合理性。
　　2.将33种双酰胺类化合物与模建的烟蚜夜蛾鱼尼汀受体进行分子对接实验，对接打分函数与实测生物活性相吻合，验证了所构建鱼尼汀受体模型的合理性。对接研究中高得分双酰胺化合物相对于低得分双酰胺化合物，拥有更强的“π-π堆积”作用以及更强的氢键作用，吡啶环在参与对接的化合物分子中起到了至关重要的作用。
　　3.将以上33种双酰胺类化合物与人2型鱼尼汀受体进行分子对接研究，对接打分结果表明以上化合物对该受体活性均较低，主要由于化合物与人2型鱼尼汀受体氢键作用与“π-π堆积”作用均较弱。
　　本论文研究结果为开发作用于鱼尼汀受体杀虫剂提供了理论依据。

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引言

第1章 文献综述

1.1 G蛋白偶联受体

1.2 GPCRs药物作用机理及其应用的广泛性

1.3 新型杀虫剂

1.4 鱼尼汀受体

第2章 计算机辅助药物设计

2.1 计算机辅助药物设计的发展

2.2 药物分子的设计

2.3 药物设计软件

第3章 烟蚜夜蛾鱼尼汀受体的同源模建

3.1 引言

3.2 研究内容

3.3 结果与讨论

第4章 双酰胺类化合物与人2型鱼尼汀受体的分子对接

4.1 引言

4.2 实验内容

4.3 结果与讨论

第5章 实验结论

5.1 实验结论

参考文献

攻读硕士期间已发表的论文

致谢