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动态性状基因座的随机回归模型定位分析方法研究

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1引言

2单个动态性状基因座的随机回归模型定位策略

3两个动态性状基因座的随机回归模型定位策略

4讨论

5结论

致谢

参考文献

附录

攻读硕士学位期间发表的学术论文

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摘要

本文把表型值随着时间(生命时期,年龄,胎次等)或其他因素(生理状态,生产水平,代谢率和环境条件等)变化的性状称为动态性状。受动物遗传育种中用来估计动态性状育种值的随机回归测定日模型思想的启发,根据Legendre多项式的正交、可加和普适的特性,将关于时间(测定日期)的Legendre多项式镶嵌在遗传模型的每个遗传效应中,以刻画QTL对动态性状变化过程的作用,构造动态性状基因定位的数学模型,提出了动态性状基因位点的随机回归模型定位策略。 本文从以下几个方面系统地研究了动态性状基因位点的随机回归模型定位策略:(1)分别建立了单个和两个动态性状基因位点的随机回归模型,并根据混合模型EM法,提炼出相应的参数求解过程;(2)采用Monte-Carlo方法模拟研究了单个和两个动态性状基因位点的随机回归模型定位策略对不同因素的反应并与函数定位策略进行了比较;(3)借助白杨树干直径增长和一个连锁群标记资料,进一步验证动态性状基因定位随机回归模型定位策略的有效性和实用性。 模拟结果表明,采用随机回归模型定位策略在检测动态性状基因座中(1)检测效率随抽样群体大小的增大而提高;(2)各估计参数的标准误随抽样群体大小增大而减小;(3)测定日密度增加,也能提高检测效率,减小各估计参数的标准误。模拟和实例分析结果都证明:以Legendre多项式为子模型的随机回归模型定位策略是有效的,优于用Logistic曲线为子模型的函数定位策略。

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