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中国东北黑土区设施土壤细菌群落的时空变化及其驱动因素

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摘要

1引言

1.1研究背景

1.2微生物的物种多样性与时空尺度

1.2.1微生物的物种多样性

1.2.2物种多样性与尺度效应

1.3土壤微生物群落的影响因素

1.3.1土壤类型和植被

1.3.2气候

1.3.3塑料薄膜

1.3.4农药和化肥

1.4土壤微生物的研究方法

1.4.1平板纯培养法

1.4.2磷脂脂肪酸法

1.4.3微平板分析法

1.4.4分子生物学技术

1.5研究目的及意义

1.6研究内容及技术路线

1.6.1研究内容

1.6.2技术路线

1.7课题来源

2材料与方法

2.1试验材料与仪器

2.1.1研究区域概况

2.1.2供试土壤样品

2.1.3试验药品

2.1.4试验仪器

2.2试验设计

2.3试验方法

2.3.1土壤样品的采集及前处理

2.3.2土壤理化指标的测定

2.3.3土壤中主要污染物的测定

2.3.4 Illumina Miseq高通量测序

2.4 Illumina Miseq高通量数据分析

2.4.1物种分类学分析

2.4.3β-多样性分析

3结果与分析

3.1东北设施黑土理化性质的时空变化特征

3.1.1土壤pH的时空变化

3.1.2土壤有机质的时空变化

3.1.3土壤阳离子交换量的时空变化

3.1.4土壤全氮的时空变化

3.1.5土壤全磷的时空变化

3.1.6土壤速效磷的时空变化

3.1.7土壤速效钾的时空变化

3.2设施黑土细菌群落多样性分析

3.2.1设施黑土细菌群落的α多样性

3.2.2设施黑土细菌群落的β多样性

3.3设施黑土细菌群落丰度时空分布特征

3.3.1细菌群落门水平时空分布特征

3.3.2细菌群落纲水平时空分布特征

3.3.3属水平细菌群落丰度的时空变化特征

3.4设施黑土细菌群落的驱动因素分析

3.4.1驱动因素的筛选

3.4.2优势菌属与环境因子的主成分分析

3.4.3优势菌属与环境因子的相关性分析

4讨论

5结论

致谢

参考文献

攻读硕士学位期间发表的学术论文

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