摘要
1 绪论
1.1 引言
1.2 黄芩植物化学成分和药理作用的研究概况
1.3 流感病毒及唾液酸酶介绍
1.3.1 流感病毒
1.3.2 唾液酸酶
1.3.3 唾液酸酶活性腔和现有唾液酸酶抑制剂的结构信息
1.4 本论文涉及到的研究内容、研究目的和研究意义
1.4.1 研究方法和内容
1.4.2 研究目的
1.4.3 研究意义
2 理论计算方法简介
2.1 分子对接
2.1.1 分子对接定义及其热力学过程
2.1.2 分子对接的基本原理
2.1.3 配体与受体识别过程中的相互作用
2.1.4 分子对接的分类
2.1.5 分子对接的一般步骤
2.1.6 分子对接软件简介
2.2 蒙特卡罗基本思想
2.3 分子力学
2.3.1 分子力场
2.3.2 分子力学基本思想
2.3.3 分子力学优化算法
2.4 分子动力学
2.4.1 分子动力学基本原理
2.4.2 分子动力学几种常用积分算法
2.4.3 分子动力学统计系综
3 唾液酸酶内Ca2+和结合水对酶活性腔的影响
3.1 计算方法
3.1.1 体系准备
3.1.2 分子对接
3.1.3 结果分析
3.2 模拟结果和讨论
3.2.1 杂原子对唾液酸酶活性腔结构的影响
3.2.2 杂原子对唾液酸酶活性腔性质的影响
3.2.3 不同唾液酸酶结构与底物BA结合模式分析
3.2.4 唾液酸结构、性质变化对底物BA结合模式的影响
3.3 本章小结
4 唾液酸酶抑制剂生物活性构象研究
4.1 计算方法
4.1.1 量子化学计算
4.1.2 唾液酸酶结构优化
4.1.3 分子对接
4.1.4 分子动力学模拟
4.1.5 结果分析
4.2 结果和讨论
4.2.1 BA构象转化
4.2.2 对接模型分析
4.3 本章小结
5 唾液酸酶与5,7,4’-三羟基-8-甲氧基黄酮相互作用研究
5.1 分子对接方法
5.1.1 体系准备
5.1.2 分子对接
5.1.3 对接结果分析
5.2 分子模拟结果
5.2.1 MF与N9亚型唾液酸酶的分子对接
5.2.2 MF与N1亚型唾液酸酶的分子对接
5.2.3 MF应用前景分析
5.3 本章小结
结论
参考文献
攻读学位期间发表的学术论文
致谢
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