LRP6基因多态性与2型糖尿病易感性的关联分析

摘要

目的：
　　探讨低密度脂蛋白受体相关蛋白6（Low density lipoprotein receptor related protein6,LRP6）基因多态性与2型糖尿病（Type2 diabetes mellitus,T2DM）易感性的关联，并评价基因与环境因素的交互作用与T2DM发生的关系。
　　方法：
　　本研究采用整群抽样的方法，以自然村为基本单位，对“农村糖尿病、肥胖及生活方式（RuralDiab）”研究中年龄18岁及以上的常住居民进行问卷调查、体格检查以及血样标本的采集，选取其中18-74岁的调查对象共计1998人纳入本次分析。采用磁珠法抽提全血基因组DNA，采用Taqman荧光探针法对LRP6基因rs11054731和rs12823243位点进行基因分型。分别采用独立样本t检验和χ2检验分析连续变量和分类变量在 T2DM组和非T2DM组间的分布差异；运用logistic回归模型评估LRP6基因多态性与T2DM发病的优势比（Odds ratio,OR）和95％可信区间（Confidence interval,CI）；运用遗传风险评分对两个位点的联合作用进行评价；根据受试者工作特征曲线下面积的改变和净重新分类指数评价遗传因素和环境因素对T2DM的判别效能，以上分析均采用SAS9.1软件完成。运用R软件Haplo.stats数据包进行单体型分析；基因与环境间的高阶交互作用则运用多因子降维模型进行评价。
　　结果：
　　研究对象共1998人，包括911名男性和1087名女性，T2DM组349人，非T2DM组1649人。
　　1.性别、年龄、文化程度、职业、吸烟、饮酒、蔬菜水果摄入及体力活动在T2DM组和非T2DM组分布差异均具有统计学意义（P<0.05）。T2DM组腰围、BMI、收缩压、舒张压、脉压差、脉搏、总胆固醇、甘油三酯、低密度脂蛋白胆固醇和空腹血糖水平均高于非T2DM组；高密度脂蛋白胆固醇水平低于T2DM组，差异具有统计学意义（P<0.001）。
　　2.LRP6基因rs11054731和rs12823243位点的基因型及等位基因分布频率在T2DM组和非 T2DM组中无统计学差异。调整协变量之前， rs11054731和rs12823243位点多态性和T2DM易感性之间未发现统计学关联（P>0.05）。调整性别、年龄、吸烟、饮酒、高脂饮食、蔬菜水果摄入、体力活动、T2DM家族史和BMI后，对于rs11054731位点，携带AG基因型的人群发生T2DM的风险是1.54(1.01-2.36)。
　　3.单体型分析发现，rs11054731和rs12823243位点GA、AT、AA、GT四种单体型在T2DM组和非T2DM组的频率分布无差异，且和T2DM易感性无统计学关联（P>0.05）。未发现遗传风险评分与T2DM发生之间存在关联。
　　4.三种模型中，与仅考虑环境因素相比，纳入遗传因素后净重新分类指数分别为3.06%、2.50%、0.79%，但对T2DM判别效能的改变不具有统计学意义（P>0.05）。rs11054731和rs12823243位点与环境因素在T2DM易感性中未发现交互作用。
　　结论：
　　本研究人群中，LRP6基因rs11054731位点AG基因型能够增加T2DM发病风险。LRP6基因两个位点的单体型和遗传风险评分与T2DM的易感性之间未发现存在关联。LRP6基因与环境因素在T2DM的发生中未发现存在交互作用。

目录

声明

中英文缩略词对照表

1 引言

2. 对象与方法

2.1 实验材料

2.2 研究对象和样本量的估计

2.3 调查内容与方法

2.4 基因组DNA的提取

2.5 LRP6基因SNP位点选择与基因分型

2.6 质量控制

2.7 统计分析

3 结果

3.1 研究对象的人口统计学特征

3.2 研究对象的体格检查和生化指标分析

3.3 LRP6基因多态性位点Hardy-Weinberg平衡检验

3.4 LRP6基因多态性位点基因型和等位基因的频率分布

3.5 rs11054731位点多态性与T2DM易感性关联

3.6 rs12823243位点多态性与T2DM易感性关联

3.7 LRP6基因单体型与T2DM易感性关联

3.8 LRP6基因遗传风险评分与T2DM易感性关联

3.9 LRP6基因遗传风险评分与环境因素对T2DM的判别效能分析

3.10 LRP6基因与环境因素的交互作用

4 讨论

4.1 环境因素与T2DM的关系

4.2 LRP6基因多态性与T2DM易感性的关联

4.3 LRP6基因多态性位点间的联合分析

4.4 LRP6基因-环境作用与T2DM的关系

4.5 研究的优点及局限性

5. 结论

参考文献

综述:LRP6基因多态性与相关疾病研究进展

个人简历

致谢